46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1643 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1643  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 
440 aa  905  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5245  peptidase M14 carboxypeptidase A  65.27 
 
 
432 aa  582  1e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.510355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0391  peptidase M14 carboxypeptidase A  57.55 
 
 
446 aa  512  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1183  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.89 
 
 
1061 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.53 
 
 
773 aa  188  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21250  predicted carboxypeptidase  31.31 
 
 
403 aa  139  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39208  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4502  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.41 
 
 
628 aa  135  2e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2367  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.07 
 
 
428 aa  131  2e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127032  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4082  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.61 
 
 
626 aa  126  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221076  normal  0.0678076 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3105  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.88 
 
 
632 aa  121  2e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000214938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5723  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.37 
 
 
439 aa  120  4e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1701  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.72 
 
 
1034 aa  116  8e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157811 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.72 
 
 
1034 aa  115  1e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6479  hypothetical protein  30.8 
 
 
606 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2489  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.63 
 
 
1074 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2507  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.84 
 
 
378 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4758  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.1 
 
 
824 aa  106  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117112  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06119  zinc carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08790)  29.86 
 
 
586 aa  84.3  4e-15  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.46 
 
 
889 aa  74.3  4e-12  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8143  hypothetical protein  25.98 
 
 
815 aa  70.9  4e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.797388 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0770  peptidase M14, carboxypeptidase A  30 
 
 
414 aa  65.5  2e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0756  peptidase M14, carboxypeptidase A  30 
 
 
414 aa  65.5  2e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0750  peptidase M14, carboxypeptidase A  30 
 
 
414 aa  65.5  2e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.992935 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32238  predicted protein  23.75 
 
 
502 aa  64.3  4e-09  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.237691  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  23.74 
 
 
821 aa  64.3  4e-09  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  26.14 
 
 
423 aa  64.3  4e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2914  carboxypeptidase A  23.29 
 
 
429 aa  61.2  4e-08  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  4.27177e-05 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5783  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.04 
 
 
457 aa  60.5  6e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0804955  normal  0.645968 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4108  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.84 
 
 
557 aa  59.7  1e-07  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  30 
 
 
262 aa  57  7e-07  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0658  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.63 
 
 
379 aa  55.5  2e-06  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.481628  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.58 
 
 
557 aa  54.3  4e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1934  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.15 
 
 
563 aa  53.9  5e-06  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0111552  hitchhiker  1.96465e-06 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3806  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.5 
 
 
356 aa  52.4  2e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0393058  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.78 
 
 
406 aa  51.2  3e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.58618e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02640  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  29.05 
 
 
507 aa  50.4  6e-05  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42459  predicted protein  23.48 
 
 
356 aa  49.7  9e-05  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0196  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.58 
 
 
386 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2921  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.75 
 
 
561 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0781  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.76 
 
 
563 aa  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1581  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.43 
 
 
559 aa  47.8  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2377  Gamma-D-glutamyl-meso-diaminopimelate peptidase  23.92 
 
 
388 aa  47  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3057  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.35 
 
 
568 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3595  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.65 
 
 
553 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0167852 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3064  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.06 
 
 
558 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.211904  normal  0.375017 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  37.88 
 
 
220 aa  43.1  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>