More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1619 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 221 aa  443  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 		 223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  33.84 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  34.45 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 245 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  33.84 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  34.83 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 224 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 231 aa  102  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 229 aa  101  9e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 233 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.56 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 233 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 235 aa  99.8  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 234 aa  99  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  34.52 
 
 		 238 aa  98.6  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 223 aa  98.6  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 217 aa  98.6  7e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 225 aa  98.2  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 230 aa  97.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 290 aa  96.7  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  30.43 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  33.94 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  38.07 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 230 aa  95.1  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 239 aa  95.1  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 241 aa  95.1  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 229 aa  94.7  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 220 aa  94.7  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 222 aa  94  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 241 aa  94  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3780  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 245 aa  93.2  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104971 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3106  transcriptional regulator, GntR family  29.83 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  33.16 
 
 		 224 aa  92.4  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 213 aa  92.4  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  28.65 
 
 		 220 aa  92  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 242 aa  92  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 		 274 aa  92  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 222 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0982  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 222 aa  91.7  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84517 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 228 aa  91.7  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 239 aa  91.7  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 224 aa  91.7  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 224 aa  91.7  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 261 aa  91.7  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2536  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00251581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  37.25 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 253 aa  90.1  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  32.12 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  43.55 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  32.12 
 
 		 263 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 248 aa  89.4  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0715  regulatory protein GntR, HTH  38.97 
 
 		 234 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  33.95 
 
 		 257 aa  89  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 233 aa  89  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 227 aa  89  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  89  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  38.64 
 
 		 248 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 256 aa  89  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 230 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  31.4 
 
 		 228 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 225 aa  88.6  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  33 
 
 		 240 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  33.5 
 
 		 240 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 238 aa  88.2  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  32.23 
 
 		 222 aa  88.2  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 235 aa  88.2  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  30.46 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>