More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1525 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 156 aa  306  5e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  59.6 
 
 		 169 aa  180  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  63.19 
 
 		 161 aa  174  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  56.46 
 
 		 233 aa  164  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 163 aa  88.6  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 176 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  43.52 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  40.38 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  44.55 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  41.03 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  41.44 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3063  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 		 168 aa  77.4  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  39.69 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  41.51 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  37.62 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  44.55 
 
 		 183 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 157 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  39 
 
 		 172 aa  70.5  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  43.82 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2059  regulatory protein, MarR  37.58 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0666418  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  39.22 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  37.39 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  41.57 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  45.05 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  39.36 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  37.72 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  35.96 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  34.45 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  40.35 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  38.24 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  40.2 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  39.22 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  39.77 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  37.39 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  39.81 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0531  MarR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 213 aa  61.2  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.180365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 194 aa  60.8  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  39.71 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37380  transcriptional regulator  34.75 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00623075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  41.77 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  50.68 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  37.93 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11940  transcriptional regulator  31.11 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.11697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  33.05 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34890  transcriptional regulator  31.65 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.7983  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  28.23 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 169 aa  57  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  28.23 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  39.81 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0741  transcriptional regulator, MarR family  30.22 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.476836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  27.42 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  31.09 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  27.42 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4301  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12510  transcriptional regulator  35.65 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>