243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1513 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1513  TrkA-N domain-containing protein  100 
 
 
224 aa  439  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7573  TrkA-N domain protein  63.06 
 
 
224 aa  276  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3574  TrkA domain-containing protein  56.36 
 
 
230 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.458769 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0214  TrkA-N  58.37 
 
 
224 aa  251  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0459  TrkA-N domain protein  56.28 
 
 
231 aa  246  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.821137  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1711  TrkA-N domain protein  57.94 
 
 
220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382687  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2841  TrkA-N domain protein  58.45 
 
 
222 aa  241  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  0.066626 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0398  TrkA-N  54.02 
 
 
224 aa  239  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81484  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36690  K+ transport system, NAD-binding component  52.02 
 
 
224 aa  231  7.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164115  normal  0.724398 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2303  putative cation transporter  52.05 
 
 
222 aa  226  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24350  K+ transport system, NAD-binding component  54.17 
 
 
221 aa  226  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3145  TrkA-N domain protein  51.36 
 
 
228 aa  224  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.436065 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3347  TrkA domain-containing protein  53.33 
 
 
228 aa  222  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18040  K+ transport system, NAD-binding component  51.57 
 
 
225 aa  217  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6144  TrkA-N  51.87 
 
 
220 aa  215  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674267  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3270  TrkA-N domain protein  49.77 
 
 
230 aa  209  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.588488  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0443  TrkA domain-containing protein  48.66 
 
 
222 aa  207  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103493 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0523  TrkA-N domain protein  48.21 
 
 
223 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06980  K+ transport system, NAD-binding component  48.62 
 
 
232 aa  205  5e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2747  TrkA-N domain protein  46.82 
 
 
235 aa  203  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0359063  hitchhiker  0.0000719315 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0505  TrkA-N domain protein  47.56 
 
 
254 aa  202  4e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0590826 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0428  TrkA-N domain protein  48.64 
 
 
225 aa  200  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0372  TrkA domain-containing protein  45.98 
 
 
222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.849541  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4249  TrkA-N domain protein  49.05 
 
 
213 aa  194  9e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4247  TrkA-N domain protein  46.88 
 
 
225 aa  193  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.61262 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24440  K+ transport system, NAD-binding component  46.82 
 
 
222 aa  186  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.800738  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0796  Trk-type K+ transport systems membrane component  41.86 
 
 
220 aa  179  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  41.31 
 
 
217 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2142  putative potassium uptake protein  40.4 
 
 
221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.897368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1854  potassium uptake protein  40.4 
 
 
221 aa  165  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0461191  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  41.9 
 
 
227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  42.86 
 
 
215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  42.11 
 
 
215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  39.9 
 
 
217 aa  158  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  37.33 
 
 
220 aa  154  9e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200527  hitchhiker  0.0000000000000167844 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  41.95 
 
 
221 aa  153  2e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  37.98 
 
 
220 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  40 
 
 
217 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  38.69 
 
 
219 aa  151  8e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  38.94 
 
 
221 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  38.94 
 
 
221 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  38.46 
 
 
221 aa  150  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  38.46 
 
 
221 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  38.46 
 
 
221 aa  150  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  38.46 
 
 
221 aa  150  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  38.46 
 
 
221 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  38.46 
 
 
221 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  38.46 
 
 
221 aa  150  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  38.46 
 
 
221 aa  150  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  38.46 
 
 
221 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  36.79 
 
 
220 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  36.79 
 
 
220 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14840  K+ transport system, NAD-binding component  41.04 
 
 
229 aa  150  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.289305  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  38.91 
 
 
233 aa  149  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  37.61 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  37.96 
 
 
221 aa  145  6e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3557  TrkA-N domain protein  38.68 
 
 
223 aa  142  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.647516  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0249  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  34.86 
 
 
232 aa  138  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0122  TrkA-N domain protein  33.66 
 
 
217 aa  137  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00122863  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3465  TrkA-N domain-containing protein  37.04 
 
 
231 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4804  TrkA-N  38.46 
 
 
231 aa  136  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  40.76 
 
 
222 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0458  potassium uptake protein KtrA  36.71 
 
 
220 aa  135  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  40.76 
 
 
222 aa  135  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0012  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 
216 aa  135  5e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1273  TrkA-N  38.03 
 
 
224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3209  TrkA-N domain protein  38.65 
 
 
231 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2828  TrkA-N domain protein  37.5 
 
 
250 aa  128  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0139  TrkA-N domain protein  35.85 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0085  K+ transport systems, NAD-binding component  35.41 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.73294e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0416  TrkA domain-containing protein  34.12 
 
 
217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000130553  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0952  TrkA-N domain protein  36.26 
 
 
217 aa  125  6e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4091  TrkA-N domain protein  35.71 
 
 
229 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0232188  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1463  TrkA-N domain protein  33.64 
 
 
220 aa  124  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00504118  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4052  TrkA-N domain protein  35.71 
 
 
229 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0339  TrkA-N domain protein  34.74 
 
 
218 aa  123  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00738023  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1584  TrkA-N  38 
 
 
219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1557  TrkA domain-containing protein  34.22 
 
 
222 aa  119  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.176981  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1928  TrkA domain-containing protein  31.67 
 
 
223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4480  TrkA domain-containing protein  33.17 
 
 
217 aa  118  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000127966 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01407  hypothetical protein  33.66 
 
 
220 aa  118  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0627  TrkA-N domain protein  41.88 
 
 
224 aa  118  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0566  potassium uptake protein TrkA, putative  33.49 
 
 
218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004055  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  33.83 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.248543  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1353  TrkA-N domain protein  34.83 
 
 
217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1793  TrkA-N domain protein  31.53 
 
 
220 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1631  Trk family potassium uptake protein , putative  30.54 
 
 
223 aa  111  9e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2522  TrkA domain-containing protein  33.82 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000136868  normal  0.0316786 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001288  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  30.29 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.91889  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1392  TrkA-N domain protein  34.46 
 
 
227 aa  108  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643107  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0630  TrkA-N domain protein  34.98 
 
 
219 aa  108  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.208337  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4281  potassium uptake protein KtrA, putative  39.39 
 
 
214 aa  107  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0529  hypothetical protein  32.54 
 
 
217 aa  107  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1642  hypothetical protein  31.46 
 
 
216 aa  107  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0750  TrkA domain-containing protein  32.84 
 
 
217 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.803573  normal  0.253071 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0088  VIC family potassium channel protein  32.44 
 
 
234 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0052  TrkA domain-containing protein  35 
 
 
232 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000156349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0050  TrkA domain-containing protein  35 
 
 
232 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0058  TrkA domain-containing protein  35 
 
 
232 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000170567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>