53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1441 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 192 aa  393  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  35.6 
 
 		 210 aa  111  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  36.16 
 
 		 198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 213 aa  99.8  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  40.13 
 
 		 214 aa  98.6  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2040  regulatory protein ArsR  38.1 
 
 		 201 aa  98.2  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.98 
 
 		 243 aa  97.8  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  34.9 
 
 		 216 aa  98.2  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  32.47 
 
 		 225 aa  96.3  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 		 180 aa  94.7  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  34.95 
 
 		 232 aa  92  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4924  transcriptional regulator, ArsR family  37.17 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  33.88 
 
 		 213 aa  89.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.46 
 
 		 213 aa  85.9  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  33.86 
 
 		 201 aa  84.7  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  32.6 
 
 		 224 aa  84.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  32.58 
 
 		 227 aa  84.3  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2852  ArsR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 230 aa  84.3  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02100  predicted transcriptional regulator  36.02 
 
 		 192 aa  77.8  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  33 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  32.91 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  48.1 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  27.47 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  31.41 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  29.74 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0321  transcriptional regulator, ArsR family  29.35 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322661  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20540  ArsR family regulatory protein  30.11 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  47.06 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  30.41 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0075  regulatory protein ArsR  27.87 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.493033  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1779  putative transcriptional regulator  34.97 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.304494  normal  0.74945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27290  hypothetical protein  43.96 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109442  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2967  transcriptional regulator, ArsR family  24.86 
 
 		 183 aa  51.2  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3356  ArsR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 226 aa  48.5  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1047  transcriptional regulator, ArsR family  37.88 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  37.88 
 
 		 113 aa  45.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0045  transcriptional regulator, ArsR family  26.76 
 
 		 142 aa  45.8  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05590  hypothetical protein  32 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.604639  normal  0.83451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  34.92 
 
 		 171 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1965  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 102 aa  42  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.891597 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0142  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 98 aa  42  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0109  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 197 aa  42  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0607  hypothetical protein  40.68 
 
 		 205 aa  41.6  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27620  predicted transcriptional regulator  25 
 
 		 166 aa  42  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  32.76 
 
 		 171 aa  41.6  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  28.28 
 
 		 108 aa  41.6  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001410  putative regulatory protein ArsR family  36.84 
 
 		 113 aa  41.2  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>