More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1427 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  100 
 
 
301 aa  599  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  36.33 
 
 
323 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  33.58 
 
 
323 aa  135  9e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  32.03 
 
 
333 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  32.26 
 
 
315 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  32.74 
 
 
337 aa  112  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  38.16 
 
 
306 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  31.5 
 
 
327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  33.5 
 
 
319 aa  109  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  28.68 
 
 
337 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  46.79 
 
 
459 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
453 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  46.43 
 
 
331 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  31.47 
 
 
348 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  45.19 
 
 
373 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  36.55 
 
 
330 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  28.78 
 
 
432 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  45.83 
 
 
366 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  29.15 
 
 
432 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  36.78 
 
 
340 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  49.46 
 
 
236 aa  98.6  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  43.48 
 
 
417 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44.57 
 
 
330 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  27.09 
 
 
394 aa  97.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  36.2 
 
 
321 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  44.95 
 
 
333 aa  97.4  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  42.45 
 
 
162 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  34.43 
 
 
343 aa  95.9  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  33.33 
 
 
350 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.45 
 
 
332 aa  94.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  40.91 
 
 
398 aa  93.6  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  46.3 
 
 
347 aa  92.8  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  45.28 
 
 
335 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  40.5 
 
 
463 aa  90.5  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  45.36 
 
 
160 aa  90.1  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  43.16 
 
 
345 aa  90.1  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  42.99 
 
 
342 aa  89.7  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.11 
 
 
235 aa  88.6  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  31.34 
 
 
323 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  42.2 
 
 
400 aa  88.2  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  35.66 
 
 
432 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  35.71 
 
 
531 aa  86.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  42.27 
 
 
350 aa  86.3  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  39.32 
 
 
392 aa  85.9  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  41.07 
 
 
347 aa  85.9  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  35.44 
 
 
348 aa  85.5  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  40.4 
 
 
491 aa  85.5  9e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  39.42 
 
 
232 aa  85.5  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40 
 
 
438 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  39.45 
 
 
502 aa  84.3  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  41.12 
 
 
501 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  44.57 
 
 
349 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  41.12 
 
 
517 aa  84  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  34.69 
 
 
337 aa  84  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  41.18 
 
 
374 aa  84  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  46.15 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  45.05 
 
 
375 aa  83.6  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  38.39 
 
 
348 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  40.57 
 
 
281 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  39.29 
 
 
363 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.86 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  36.48 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  29.35 
 
 
367 aa  82.4  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  38.39 
 
 
348 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  39.25 
 
 
452 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  38.78 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  42.39 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0041  NLP/P60  37.12 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.430296  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  35.42 
 
 
458 aa  81.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  31.34 
 
 
348 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  32.64 
 
 
348 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5763  NLP/P60 protein  37.61 
 
 
362 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.6 
 
 
475 aa  80.9  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  39.13 
 
 
363 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  37.59 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  46.81 
 
 
446 aa  80.5  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  45.16 
 
 
524 aa  79.7  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  29.21 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  38.32 
 
 
370 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  41.3 
 
 
380 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  40 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  38.68 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  38.68 
 
 
368 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  34.72 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4593  NLP/P60 protein  43.62 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00530725  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  37.96 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  39.22 
 
 
259 aa  76.3  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  37.04 
 
 
362 aa  76.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  39.6 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  36 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  34.58 
 
 
476 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  38.38 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  38.38 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13280  NlpC/P60 family protein  25.89 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.401944  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  40.91 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  38.4 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  35.94 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  38.38 
 
 
363 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  35.92 
 
 
164 aa  73.9  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  32.35 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>