More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1335 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  374  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  34.5 
 
 		 203 aa  98.2  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 197 aa  86.3  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 367 aa  75.9  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  30.23 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  34.27 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  30.95 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1574  regulatory protein, TetR  35.37 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.979673 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1523  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2212  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326547  normal  0.584634 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2564  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.454515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0088  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13760  transcriptional regulator, tetR family  34.13 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484561  normal  0.0851511 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 222 aa  57.8  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3158  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3988  regulatory protein, TetR  33.1 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100564  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2069  regulatory protein, TetR  36.63 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.168032  normal  0.867534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  31.96 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  29.29 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  31.95 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3426  putative transcriptional regulator  30.81 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  25 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40380  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0161  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1898  transcriptional regulator BetI  29.95 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  32.48 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  45.33 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4351  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.710621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  34.78 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  24.56 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  26.95 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 207 aa  52  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1590  transcriptional regulator BetI  31.36 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  30.25 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1503  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 215 aa  52  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0825242 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 429 aa  52.4  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  29.17 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 218 aa  51.6  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  45.9 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 199 aa  52  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  29.07 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>