More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1321 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 308 aa  590  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 300 aa  159  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  38.87 
 
 		 324 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  36.96 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  39.58 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  36.05 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  36.79 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  33.45 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  37.37 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 291 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  37.76 
 
 		 304 aa  143  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  38.31 
 
 		 316 aa  139  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  34 
 
 		 298 aa  139  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  34.87 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  34.94 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  35.43 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  33.45 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  36.79 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  40.08 
 
 		 287 aa  136  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  37.75 
 
 		 319 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 283 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  36.21 
 
 		 310 aa  133  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  36.59 
 
 		 308 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  34.47 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  31.62 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  38.3 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  35.25 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  33.01 
 
 		 314 aa  126  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  27.43 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  37.21 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  32.62 
 
 		 301 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  33.81 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  35.46 
 
 		 327 aa  123  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 314 aa  123  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  37 
 
 		 303 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  34.94 
 
 		 327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  29.87 
 
 		 302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 304 aa  119  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  29.54 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 315 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  34.97 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  36.09 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  34.89 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2187  LysR substrate-binding protein  34.78 
 
 		 309 aa  116  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2120  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 319 aa  116  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  27.71 
 
 		 300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3722  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  34.41 
 
 		 294 aa  115  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 288 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06400  transcriptional regulator  35.88 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.450023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  34.52 
 
 		 310 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4518  LysR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 306 aa  112  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  34.22 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 		 309 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  34.98 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  33.22 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  30.51 
 
 		 302 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  24.01 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  37.75 
 
 		 350 aa  109  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4505  transcriptional regulator, LysR family  34.71 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  33.82 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2390  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  33.96 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  23.3 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  35.25 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 300 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 		 292 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  32.94 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 296 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>