More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1243 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 518 aa  986    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  53.27 
 
 		 526 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  47.84 
 
 		 524 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  51.06 
 
 		 536 aa  443  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  51.71 
 
 		 513 aa  425  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  50.4 
 
 		 529 aa  425  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  50.89 
 
 		 517 aa  420  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  46.78 
 
 		 528 aa  415  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  48.11 
 
 		 562 aa  411  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  48.24 
 
 		 521 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  46.75 
 
 		 509 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  49.32 
 
 		 539 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  46.76 
 
 		 558 aa  398  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  50.81 
 
 		 496 aa  392  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  50.53 
 
 		 481 aa  395  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  46.88 
 
 		 501 aa  390  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  47.38 
 
 		 540 aa  391  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  50.21 
 
 		 516 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  45.06 
 
 		 509 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  47.49 
 
 		 588 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  44.92 
 
 		 528 aa  377  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  45.15 
 
 		 553 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  51.62 
 
 		 502 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  45.69 
 
 		 584 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  47.77 
 
 		 509 aa  372  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  44.67 
 
 		 509 aa  365  1e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  45.44 
 
 		 508 aa  362  9e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  48.32 
 
 		 506 aa  362  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  43.14 
 
 		 516 aa  359  8e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  41.88 
 
 		 514 aa  358  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  42.61 
 
 		 533 aa  356  5e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 525 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  42.86 
 
 		 525 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  51.6 
 
 		 477 aa  354  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 525 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  43.08 
 
 		 541 aa  353  4e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  45.11 
 
 		 575 aa  352  7e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 		 521 aa  346  7e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  43.25 
 
 		 535 aa  345  8.999999999999999e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  44.4 
 
 		 554 aa  342  8e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  42.48 
 
 		 519 aa  337  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  44.77 
 
 		 528 aa  334  2e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  44.86 
 
 		 513 aa  334  3e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  44.64 
 
 		 563 aa  332  1e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  40.76 
 
 		 532 aa  332  1e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  45.03 
 
 		 514 aa  330  5.0000000000000004e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  42.16 
 
 		 555 aa  327  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  42.77 
 
 		 535 aa  325  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.48 
 
 		 537 aa  325  1e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  45.25 
 
 		 497 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  42.63 
 
 		 505 aa  323  4e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  42.69 
 
 		 513 aa  320  3e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  43.2 
 
 		 601 aa  316  7e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  44.31 
 
 		 524 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  41.63 
 
 		 503 aa  303  7.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  41.89 
 
 		 508 aa  295  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  40.81 
 
 		 490 aa  291  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  39.92 
 
 		 517 aa  290  3e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 		 516 aa  286  8e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.07 
 
 		 538 aa  282  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  38.97 
 
 		 511 aa  280  6e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  44.09 
 
 		 536 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.55 
 
 		 534 aa  271  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  37.75 
 
 		 500 aa  270  5e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  37.4 
 
 		 492 aa  269  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.11 
 
 		 525 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  39.13 
 
 		 517 aa  256  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  38.08 
 
 		 500 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  36.75 
 
 		 516 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  36.78 
 
 		 500 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  36.31 
 
 		 519 aa  248  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  35.24 
 
 		 503 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 		 520 aa  248  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.34 
 
 		 532 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 495 aa  243  6e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  34.24 
 
 		 516 aa  242  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  39.07 
 
 		 514 aa  242  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  36.12 
 
 		 503 aa  241  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  36.33 
 
 		 504 aa  241  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  39.75 
 
 		 528 aa  240  4e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 		 510 aa  236  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.87 
 
 		 519 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  37.5 
 
 		 513 aa  233  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  37.87 
 
 		 507 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  39.63 
 
 		 511 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.22 
 
 		 607 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 509 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.54 
 
 		 522 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  36.05 
 
 		 501 aa  223  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1370  major facilitator superfamily MFS_1  38.28 
 
 		 506 aa  220  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.55 
 
 		 503 aa  219  7e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3332  major facilitator superfamily MFS_1  38.2 
 
 		 515 aa  219  8.999999999999998e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.25944 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.61 
 
 		 520 aa  217  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  35.47 
 
 		 494 aa  215  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  35.92 
 
 		 495 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  35.92 
 
 		 495 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  35.92 
 
 		 495 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1752  methyl viologen resistance protein SmvA  35.92 
 
 		 495 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  35.92 
 
 		 495 aa  211  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  33.6 
 
 		 502 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>