21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1230 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1230  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  531  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1607  hypothetical protein  40.44 
 
 		 247 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1992  hypothetical protein  40.34 
 
 		 235 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000239593  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5510  hypothetical protein  32.37 
 
 		 205 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242777  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3439  hypothetical protein  30.91 
 
 		 464 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.492006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7214  hypothetical protein  32.61 
 
 		 246 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.906304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6886  hypothetical protein  31.98 
 
 		 258 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4575  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.3 
 
 		 513 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6887  hypothetical protein  32 
 
 		 524 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4877  AAA ATPase  31.93 
 
 		 856 aa  70.1  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8334  hypothetical protein  28.48 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0824373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5505  hypothetical protein  29.41 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337015  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0492  hypothetical protein  28.65 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0398  hypothetical protein  27.72 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0964  hypothetical protein  29.41 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0063713  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1332  hypothetical protein  28.02 
 
 		 751 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0324065  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6990  hypothetical protein  30.81 
 
 		 281 aa  53.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0692886  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3720  hypothetical protein  27.22 
 
 		 283 aa  52.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0633  hypothetical protein  27.14 
 
 		 209 aa  48.9  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2682  hypothetical protein  26.78 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0583833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1166  hypothetical protein  23.12 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>