58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1225 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 193 aa  391  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.56 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3356  ArsR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 186 aa  98.2  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  38.1 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  36.46 
 
 		 211 aa  94.4  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  37.43 
 
 		 225 aa  92.4  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 		 210 aa  89  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  34.41 
 
 		 191 aa  88.2  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  33.89 
 
 		 230 aa  86.7  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 		 243 aa  85.9  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  35.57 
 
 		 224 aa  84.3  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1779  putative transcriptional regulator  39.6 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.304494  normal  0.74945 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  29.19 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27290  hypothetical protein  33.53 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109442  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  33.9 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  32.04 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  32.95 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  35 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.6 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  31.33 
 
 		 206 aa  67.8  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0075  regulatory protein ArsR  28.43 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.493033  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02100  predicted transcriptional regulator  33.57 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  35.86 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  29.19 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2040  regulatory protein ArsR  31.68 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  29.68 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  38.36 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  29.12 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1606  transcriptional regulatory protein, putative  23.6 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00436475  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05590  hypothetical protein  47.3 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.604639  normal  0.83451 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4924  transcriptional regulator, ArsR family  29.59 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1887  putative transcriptional regulatory protein  23.03 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.471019  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2852  ArsR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0321  transcriptional regulator, ArsR family  34.06 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322661  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20540  ArsR family regulatory protein  28.11 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  28.74 
 
 		 472 aa  45.1  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00475  transcriptional regulator, ArsR family protein  25 
 
 		 109 aa  43.9  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.727712  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 437 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1506  transcriptional regulator, ArsR family  32 
 
 		 94 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938666  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  32.47 
 
 		 113 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  27.1 
 
 		 230 aa  42.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2967  transcriptional regulator, ArsR family  28.83 
 
 		 183 aa  42.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1047  transcriptional regulator, ArsR family  32.76 
 
 		 194 aa  42  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001410  putative regulatory protein ArsR family  33.33 
 
 		 113 aa  42  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2810  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 229 aa  42  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 116 aa  42  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5378  transcriptional regulator, ArsR family  39.06 
 
 		 215 aa  42  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 105 aa  41.6  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  30.91 
 
 		 107 aa  41.6  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  30.91 
 
 		 107 aa  41.6  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 108 aa  41.2  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1439  transcriptional regulator, ArsR family  36.23 
 
 		 125 aa  41.2  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>