255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1213 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1213  50S ribosomal protein L36  100 
 
 		 38 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00959  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 		 38 aa  63.9  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000239291  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3158  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 		 38 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3295  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 		 38 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1010  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  62.8  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000678722  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5149  ribosomal protein L36  84.21 
 
 		 37 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.982294  normal  0.58314 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0508  ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 55 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.130854  hitchhiker  0.00874206 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09070  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.417954 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06460  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0858  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0475  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219186 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0647  ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4728  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243342  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3888  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00159643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1460  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 39 aa  60.5  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000282576  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3500  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 46 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1946  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 46 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.779159  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3724  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 46 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0547196  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0426  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.128717  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3782  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2610  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3622  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00017542  hitchhiker  0.000000000119611 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3754  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0869692  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0271  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0386198 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3469  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3046  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.13587  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0336  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.191743  hitchhiker  0.00985215 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2737  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.88036  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0349  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0968367 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0289  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0370  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0298  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00439653  normal  0.106289 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3147  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0831779  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2817  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111902  normal  0.172342 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0344  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0208995  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2997  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.373572 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0304  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000229696  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3275  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000772406 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3980  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208556  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2928  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000201149 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3801  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0207121  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0081  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000265715  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2378  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  59.3  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000145037  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0617  50S ribosomal protein L36P  71.05 
 
 		 39 aa  59.3  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000046769  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1884  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000386083  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0740  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 		 37 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00337234  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4294  ribosomal protein L36  81.58 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3594  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0054931  normal  0.0468357 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03150  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836067  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0414  ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000033684  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0414  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000552081  unclonable  0.0000000117832 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0510  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.106687  hitchhiker  0.00286829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2621  50S ribosomal protein L36P  76.32 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.775374  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3493  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000232904  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3899  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3782  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000525761  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0980  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194486  hitchhiker  0.00368678 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03101  hypothetical protein  63.16 
 
 		 38 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0561863  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4622  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000900319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4290  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.856971  hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0349  ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  57.8  0.00000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17201  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0505  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  57.8  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000136096  normal  0.026153 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3730  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  57.4  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00190831  hitchhiker  0.00407202 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0313  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  57.4  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00358606  unclonable  6.93478e-29 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0218  50S ribosomal protein L36P  65.79 
 
 		 39 aa  57.4  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.208607  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2658  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 37 aa  57  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2943  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 37 aa  57  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.702617  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13498  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 		 37 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000103834  normal  0.841805 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1138  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 		 37 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.61237  normal  0.353832 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4221  ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 43 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.238341  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0442  50S ribosomal protein L36P  71.05 
 
 		 41 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.817309  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1109  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 		 37 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1730  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 37 aa  56.6  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.544238  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1126  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 		 37 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.384917  normal  0.806869 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0274  ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 37 aa  56.2  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1432  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 		 37 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.846939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2153  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000225133  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001721  LSU ribosomal protein L36p  73.68 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000373745  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3927  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0341  50S ribosomal protein L36P  73.68 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000597452  unclonable  0.0000000332549 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4255  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277487  unclonable  0.00000000000170252 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23560  LSU ribosomal protein L36P  76.32 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00751  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0479  50S ribosomal protein L36P  76.32 
 
 		 37 aa  56.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2303  50S ribosomal protein L36P  76.32 
 
 		 37 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.494369  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3421  50S ribosomal protein L36P  73.68 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16581  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.731306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3724  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 37 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0350  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  54.7  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0325149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1956  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1923  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0497  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 37 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1934  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0520  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  54.7  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.130512  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0868  50S ribosomal protein L36P  73.68 
 
 		 37 aa  54.3  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000807899  hitchhiker  0.00596219 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2041  50S ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.89804  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0341  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 37 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.165247  hitchhiker  0.000355537 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2148  ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 37 aa  53.9  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0657747  normal  0.398863 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3316  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 37 aa  53.9  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.696898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>