More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1189 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1189  30S ribosomal protein S19  100 
 
 		 93 aa  188  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0653663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4311  30S ribosomal protein S19  80.65 
 
 		 93 aa  159  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3919  30S ribosomal protein S19  80.65 
 
 		 93 aa  159  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5128  ribosomal protein S19  81.52 
 
 		 92 aa  154  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6610  ribosomal protein S19  79.57 
 
 		 93 aa  150  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04020  SSU ribosomal protein S19P  79.57 
 
 		 93 aa  150  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.904114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0566  30S ribosomal protein S19  79.35 
 
 		 92 aa  150  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0310  30S ribosomal protein S19  79.35 
 
 		 93 aa  150  7e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187056 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1127  ribosomal protein S19  78.26 
 
 		 93 aa  150  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.831563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4317  ribosomal protein S19  79.35 
 
 		 93 aa  149  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20830  30S ribosomal protein S19  76.09 
 
 		 92 aa  149  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4503  ribosomal protein S19  77.17 
 
 		 93 aa  149  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  76.34 
 
 		 93 aa  147  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2642  SSU ribosomal protein S19P  77.17 
 
 		 92 aa  147  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.570508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1090  30S ribosomal protein S19  76.09 
 
 		 92 aa  147  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0844216 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2655  ribosomal protein S19  74.19 
 
 		 93 aa  147  7e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1309  30S ribosomal protein S19  76.34 
 
 		 93 aa  147  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415086  normal  0.102263 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10719  30S ribosomal protein S19  75.27 
 
 		 93 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.560637  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5045  30S ribosomal protein S19  75.27 
 
 		 93 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0166823  normal  0.166411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6045  30S ribosomal protein S19  76.09 
 
 		 93 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.852276  normal  0.340402 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1044  30S ribosomal protein S19  75.27 
 
 		 93 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0586  30S ribosomal protein S19  76.09 
 
 		 93 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1017  30S ribosomal protein S19  75.27 
 
 		 93 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0692  30S ribosomal protein S19  72.04 
 
 		 93 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.40634 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  75.27 
 
 		 93 aa  145  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1034  30S ribosomal protein S19  75.27 
 
 		 93 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702423  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3139  ribosomal protein S19  74.19 
 
 		 93 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3901  SSU ribosomal protein S19P  75.27 
 
 		 93 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2971  30S ribosomal protein S19  73.12 
 
 		 93 aa  144  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.241839  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0591  30S ribosomal protein S19  74.19 
 
 		 93 aa  144  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.187847  normal  0.796631 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2683  30S ribosomal protein S19  73.12 
 
 		 93 aa  143  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  69.89 
 
 		 93 aa  142  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103026  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29700  SSU ribosomal protein S19P  73.12 
 
 		 93 aa  142  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0631  ribosomal protein S19  73.12 
 
 		 93 aa  142  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  74.16 
 
 		 90 aa  142  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0108  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 		 92 aa  141  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17120  30S ribosomal protein S19  74.19 
 
 		 93 aa  142  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0814884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0145  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 		 92 aa  141  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000029175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0114  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 		 92 aa  141  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0114  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 		 92 aa  141  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000383993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0110  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 		 92 aa  141  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.16547e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0108  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 		 92 aa  141  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000559577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0114  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 		 92 aa  141  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000118397  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0126  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 		 92 aa  141  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0588  30S ribosomal protein S19  71.74 
 
 		 92 aa  140  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935387  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0109  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 		 92 aa  141  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000185939  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3911  30S ribosomal protein S19  71.74 
 
 		 92 aa  140  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000343627  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0135  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 		 92 aa  141  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000777644  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0287  30S ribosomal protein S19  71.74 
 
 		 92 aa  140  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000109471  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 		 91 aa  140  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000043477  hitchhiker  0.00000613779 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 		 91 aa  140  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  0.000000116532 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3997  30S ribosomal protein S19  71.74 
 
 		 92 aa  140  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00000877043  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  70.65 
 
 		 92 aa  140  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23770  SSU ribosomal protein S19P  70.97 
 
 		 93 aa  140  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.384617  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2398  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 		 92 aa  140  5e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0423225  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3818  30S ribosomal protein S19  71.74 
 
 		 92 aa  140  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000535385  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0935  ribosomal protein S19  72.83 
 
 		 93 aa  140  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0283  SSU ribosomal protein S19P  73.63 
 
 		 91 aa  140  8e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000019413  hitchhiker  0.00000161799 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0324  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0470216  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06290  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 		 91 aa  139  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336646  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001738  SSU ribosomal protein S19p (S15e)  70.65 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  74.16 
 
 		 90 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 		 91 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000724937  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  72.73 
 
 		 91 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  72.73 
 
 		 91 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927803  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3175  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 		 91 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00320627  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  72.73 
 
 		 91 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  72.73 
 
 		 91 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  72.73 
 
 		 91 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  72.73 
 
 		 91 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000490482  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  72.73 
 
 		 91 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000218247  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  72.73 
 
 		 91 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  72.73 
 
 		 91 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  72.73 
 
 		 91 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 		 92 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2755  30S ribosomal protein S19  72.73 
 
 		 91 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000407777  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  72.73 
 
 		 91 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442981  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  72.73 
 
 		 91 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  72.73 
 
 		 91 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000490611  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  72.73 
 
 		 91 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3165  30S ribosomal protein S19  72.73 
 
 		 91 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403295  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  72.73 
 
 		 91 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 		 92 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0430  30S ribosomal protein S19  73.86 
 
 		 91 aa  138  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377773  decreased coverage  0.00000532224 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0062  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 		 92 aa  138  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.235454  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0341  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 		 95 aa  138  3e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  6.9817e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  79.52 
 
 		 94 aa  138  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3663  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 		 92 aa  138  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230775  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1850  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 		 95 aa  138  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000178079  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  72.73 
 
 		 91 aa  137  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291736  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0083  30S ribosomal protein S19  75.9 
 
 		 93 aa  138  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974328 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0869  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 		 91 aa  137  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0425  SSU ribosomal protein S19P  71.43 
 
 		 91 aa  137  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0443512  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0473  ribosomal protein S19  71.43 
 
 		 91 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000607565  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0462  SSU ribosomal protein S19P  74.7 
 
 		 90 aa  137  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1903  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 		 92 aa  137  4.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  68.48 
 
 		 92 aa  137  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  68.42 
 
 		 95 aa  137  6e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1711  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 		 92 aa  137  6e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.374721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>