48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1132 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1132  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  611  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0290503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4018  hypothetical protein  45.02 
 
 		 331 aa  258  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3390  hypothetical protein  40.53 
 
 		 356 aa  232  5e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1133  hypothetical protein  42.77 
 
 		 358 aa  232  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3632  hypothetical protein  41.27 
 
 		 347 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.960299  hitchhiker  0.000777335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0370  hypothetical protein  35.99 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0441  hypothetical protein  38.51 
 
 		 333 aa  183  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0443  hypothetical protein  32.25 
 
 		 366 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0531  hypothetical protein  32.9 
 
 		 338 aa  163  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202558  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  29.25 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  25.67 
 
 		 339 aa  103  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7309  hypothetical protein  28.81 
 
 		 324 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  26.47 
 
 		 336 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  25.09 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0294  hypothetical protein  24.34 
 
 		 322 aa  93.2  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  25.93 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0930  hypothetical protein  25.68 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  22.76 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2527  hypothetical protein  32.16 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  39.36 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  26.4 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  31.78 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.36 
 
 		 547 aa  63.9  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  32.17 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.01 
 
 		 554 aa  59.3  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  28.91 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3610  peptidase M23B  27.27 
 
 		 363 aa  53.9  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1943  hypothetical protein  29.69 
 
 		 289 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.762706  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  22.9 
 
 		 434 aa  51.6  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  29.01 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  33.61 
 
 		 331 aa  50.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  26.21 
 
 		 306 aa  49.3  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0540  hypothetical protein  26.24 
 
 		 366 aa  49.3  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  43.64 
 
 		 767 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  24.36 
 
 		 363 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  25.9 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1369  hypothetical protein  43.86 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  23.75 
 
 		 327 aa  46.6  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27870  hypothetical protein  31.82 
 
 		 227 aa  45.8  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.86582  normal  0.0220968 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  33.33 
 
 		 1048 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  31.46 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  22.82 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  26.96 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1272  TP901 family phage tail tape measure protein  24.68 
 
 		 1183 aa  44.3  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574053 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  27.97 
 
 		 375 aa  43.9  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  23.58 
 
 		 350 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2034  TP901 family phage tail tape measure protein  24.68 
 
 		 1183 aa  43.5  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.5433  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  18.18 
 
 		 340 aa  42.7  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>