228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0959 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0959  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  328  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0409  putative nucleotide-binding protein  72.84 
 
 
164 aa  244  6e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0477  putative nucleotide-binding protein  70.99 
 
 
164 aa  238  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03430  hypothetical protein  69.33 
 
 
163 aa  236  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.405869  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10576  putative nucleotide-binding protein  71.78 
 
 
163 aa  234  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.703775 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0997  putative nucleotide-binding protein  65.64 
 
 
163 aa  221  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446557  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4534  protein of unknown function DUF520  64.42 
 
 
163 aa  218  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.452055  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1006  protein of unknown function DUF520  65.03 
 
 
163 aa  217  6e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1104  protein of unknown function DUF520  63.8 
 
 
163 aa  216  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237734  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0777  putative nucleotide-binding protein  62.58 
 
 
179 aa  216  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0791  putative nucleotide-binding protein  62.58 
 
 
179 aa  216  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0772  putative nucleotide-binding protein  62.58 
 
 
179 aa  216  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.596495  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0332  hypothetical protein  61.96 
 
 
163 aa  213  5.9999999999999996e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.408979  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0564  putative nucleotide-binding protein  61.35 
 
 
163 aa  214  5.9999999999999996e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6653  putative nucleotide-binding protein  61.96 
 
 
163 aa  213  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59339  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4374  protein of unknown function DUF520  62.58 
 
 
162 aa  212  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5248  putative nucleotide-binding protein  61.96 
 
 
163 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6074  putative nucleotide-binding protein  63.8 
 
 
162 aa  211  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0736  protein of unknown function DUF520  60.74 
 
 
163 aa  206  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0690  nucleotide-binding protein  61.59 
 
 
164 aa  204  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.310071 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0558  putative nucleotide-binding protein  61.35 
 
 
162 aa  202  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0662  putative nucleotide-binding protein  60.38 
 
 
163 aa  201  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103714  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21450  hypothetical protein  60.74 
 
 
162 aa  200  8e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000199035  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3188  protein of unknown function DUF520  59.39 
 
 
167 aa  199  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171819  normal  0.0244342 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2672  putative nucleotide-binding protein  58.9 
 
 
165 aa  198  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0508  protein of unknown function DUF520  59.39 
 
 
164 aa  197  5e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2696  protein of unknown function DUF520  59.01 
 
 
165 aa  194  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2778  putative nucleotide-binding protein  59.04 
 
 
163 aa  192  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00451374 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5091  protein of unknown function DUF520  57.67 
 
 
165 aa  193  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413017  normal  0.812219 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0286  putative nucleotide-binding protein  55.83 
 
 
163 aa  192  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0561  protein of unknown function DUF520  56.97 
 
 
165 aa  191  5e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.637028  normal  0.064143 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17650  putative nucleotide-binding protein  57.06 
 
 
162 aa  186  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.839683  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0858  protein of unknown function DUF520  55.56 
 
 
163 aa  186  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83182  hitchhiker  0.00457625 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3073  putative nucleotide-binding protein  56.63 
 
 
163 aa  186  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760306  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07620  hypothetical protein  56.88 
 
 
159 aa  180  6e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0480829 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21350  hypothetical protein  53.37 
 
 
167 aa  167  6e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0391235  hitchhiker  0.000130122 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0379  protein of unknown function DUF520  49.08 
 
 
164 aa  152  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0120708  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  50.62 
 
 
164 aa  149  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4497  putative nucleotide-binding protein  46.88 
 
 
161 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1352  putative nucleotide-binding protein  46.88 
 
 
161 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154119  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4372  putative nucleotide-binding protein  46.88 
 
 
161 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0514431 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2254  putative nucleotide-binding protein  48.12 
 
 
160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000945037  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3156  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 
161 aa  145  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0811  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 
161 aa  145  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0782  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 
161 aa  145  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0939  putative nucleotide-binding protein  49.38 
 
 
159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911761  normal  0.507719 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2261  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 
160 aa  144  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.299234  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2033  hypothetical protein  47.88 
 
 
161 aa  144  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2524  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
161 aa  143  8.000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983821  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02358  putative nucleotide-binding protein  46.88 
 
 
160 aa  142  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3815  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  142  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3487  putative nucleotide-binding protein  47.5 
 
 
160 aa  142  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660179  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 
166 aa  141  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0818  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
161 aa  140  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  44.72 
 
 
161 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  44.72 
 
 
161 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  46.91 
 
 
163 aa  139  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 
161 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  45.06 
 
 
163 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4311  putative nucleotide-binding protein  47.5 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57751  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1993  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 
160 aa  138  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0973999  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0203  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 
160 aa  138  3e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 
160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4421  putative nucleotide-binding protein  46.25 
 
 
161 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425503  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003420  protein yajQ  45.62 
 
 
160 aa  137  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  46.3 
 
 
161 aa  137  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1115  putative nucleotide-binding protein  46.25 
 
 
160 aa  137  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1084  putative nucleotide-binding protein  46.91 
 
 
163 aa  136  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.235952  hitchhiker  0.00000304548 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04099  nucleotide-binding protein  47.5 
 
 
160 aa  136  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  43.83 
 
 
162 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3275  putative nucleotide-binding protein  45.06 
 
 
163 aa  136  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1169  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1175  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3104  putative nucleotide-binding protein  46.3 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  45.62 
 
 
160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  45.06 
 
 
161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3067  putative nucleotide-binding protein  46.3 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3079  putative nucleotide-binding protein  46.3 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421568  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2888  putative nucleotide-binding protein  46.3 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3247  putative nucleotide-binding protein  46.3 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  46.91 
 
 
161 aa  134  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03091  putative nucleotide-binding protein  41.72 
 
 
172 aa  134  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2557  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 
161 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.317915 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1902  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 
161 aa  134  8e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1098  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 
160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0095  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.615818  normal  0.24721 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3306  hypothetical protein  44.38 
 
 
163 aa  131  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0893  putative nucleotide-binding protein  45.68 
 
 
163 aa  132  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13410  putative nucleotide-binding protein  43.75 
 
 
159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2001  putative nucleotide-binding protein  44.17 
 
 
163 aa  130  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4966  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 
159 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0537  putative nucleotide-binding protein  45.68 
 
 
163 aa  130  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.323651  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0101  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 
162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1273  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 
163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152949  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1059  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 
163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0474  putative nucleotide-binding protein  45.68 
 
 
163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0348  putative nucleotide-binding protein  45.68 
 
 
163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>