More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0873 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03941  acetyl-coenzyme A synthetase  51.34 
 
 
652 aa  644    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3923  acetate/CoA ligase  51.34 
 
 
652 aa  644    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  49.92 
 
 
652 aa  639    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  49.75 
 
 
652 aa  641    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4702  acetyl-CoA synthetase  51.55 
 
 
644 aa  657    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  51.15 
 
 
662 aa  642    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  51.52 
 
 
660 aa  657    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1744  acetyl-CoA synthetase  52.47 
 
 
651 aa  647    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0688  acetyl-coenzyme A synthetase  53.14 
 
 
651 aa  642    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84853  normal  0.838987 
 
 
-
 
NC_004310  BR1811  acetyl-CoA synthetase  52.31 
 
 
651 aa  646    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0628  acetyl-CoA synthetase  51.83 
 
 
660 aa  652    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185058  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1825  acetyl-CoA synthetase  52.09 
 
 
651 aa  635    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.90086  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  51.83 
 
 
660 aa  652    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3572  acetyl-CoA synthetase  52.29 
 
 
651 aa  637    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  52.41 
 
 
654 aa  654    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  70.6 
 
 
656 aa  961    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  54.92 
 
 
658 aa  734    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  51.29 
 
 
660 aa  668    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  52.61 
 
 
655 aa  692    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  52.06 
 
 
632 aa  641    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  56.62 
 
 
657 aa  749    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  51.83 
 
 
660 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  54.81 
 
 
657 aa  721    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4293  acetyl-CoA synthetase  52.01 
 
 
651 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4814  acetyl-CoA synthetase  51.66 
 
 
645 aa  640    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422495  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2880  acetate--CoA ligase  50.53 
 
 
664 aa  639    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.287628  normal  0.570573 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  52.59 
 
 
660 aa  671    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  52.9 
 
 
667 aa  716    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  57.19 
 
 
673 aa  758    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  54.43 
 
 
666 aa  737    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  57.12 
 
 
657 aa  743    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2823  acetyl-coenzyme A synthetase  49.69 
 
 
659 aa  640    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252504  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  53.98 
 
 
661 aa  676    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  54.73 
 
 
653 aa  719    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0276  acetyl-CoA synthetase  50.31 
 
 
652 aa  636    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  53.36 
 
 
660 aa  711    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  56.95 
 
 
656 aa  760    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  76.43 
 
 
715 aa  1067    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  51.07 
 
 
660 aa  650    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  52.57 
 
 
631 aa  653    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3663  acetyl-coenzyme A synthetase  55.52 
 
 
667 aa  710    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0319  acetyl-CoA synthetase  52.52 
 
 
652 aa  647    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.994772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3479  acetyl-coenzyme A synthetase  52.66 
 
 
645 aa  639    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.837124  hitchhiker  0.000568147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4567  acetyl-CoA synthetase  51.86 
 
 
644 aa  659    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0530  acetyl-CoA synthetase  51.83 
 
 
660 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  52.52 
 
 
629 aa  647    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1067  acetyl-CoA synthetase  52.8 
 
 
645 aa  646    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  55.88 
 
 
656 aa  739    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  50.84 
 
 
654 aa  664    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2049  acetyl-coenzyme A synthetase  50.37 
 
 
665 aa  635    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0296505 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  52.81 
 
 
645 aa  664    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  51.06 
 
 
660 aa  656    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1522  acetyl-CoA synthetase  49.38 
 
 
657 aa  635    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  54.26 
 
 
649 aa  738    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  52.67 
 
 
650 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2054  acetyl-CoA synthetase  51.83 
 
 
660 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  54.48 
 
 
658 aa  728    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  53.19 
 
 
660 aa  728    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  51.83 
 
 
660 aa  674    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  57.63 
 
 
652 aa  754    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  56.26 
 
 
655 aa  750    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  52.13 
 
 
664 aa  668    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  52.29 
 
 
660 aa  667    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  67.77 
 
 
660 aa  882    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  57.37 
 
 
644 aa  743    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  54.13 
 
 
660 aa  720    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3431  acetyl-CoA synthetase  53.45 
 
 
654 aa  635    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405806  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  51.6 
 
 
657 aa  658    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  55.42 
 
 
655 aa  731    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1380  acetyl-CoA synthetase  65.83 
 
 
653 aa  837    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.110945  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  54.26 
 
 
660 aa  724    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  52.58 
 
 
645 aa  658    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1385  acetyl-coenzyme A synthetase  52.46 
 
 
633 aa  637    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  56.55 
 
 
658 aa  746    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  52.59 
 
 
660 aa  668    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  51.98 
 
 
664 aa  662    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  52.95 
 
 
644 aa  647    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  52.39 
 
 
645 aa  641    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0533  acetyl-coenzyme A synthetase  53.76 
 
 
670 aa  671    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1759  acetyl-coenzyme A synthetase  67.48 
 
 
673 aa  870    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  66.62 
 
 
676 aa  892    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  52.29 
 
 
660 aa  667    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  52.13 
 
 
664 aa  668    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0788  acetyl-CoA synthetase  51.83 
 
 
660 aa  652    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  51.83 
 
 
670 aa  671    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  50.08 
 
 
660 aa  652    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1081  acetyl-CoA synthetase  51.83 
 
 
660 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.476732  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  53.12 
 
 
650 aa  653    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  50.57 
 
 
656 aa  647    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  53.88 
 
 
644 aa  671    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3109  acetyl-CoA synthetase  53.09 
 
 
653 aa  639    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  68.5 
 
 
657 aa  944    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  54.21 
 
 
667 aa  733    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  67.77 
 
 
666 aa  882    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  53.99 
 
 
661 aa  681    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  50.32 
 
 
638 aa  641    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0346  acetyl-CoA synthetase  70.29 
 
 
664 aa  923    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  53.58 
 
 
645 aa  641    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  51.37 
 
 
667 aa  638    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  67.77 
 
 
660 aa  882    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.151369 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>