88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0870 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 171 aa  344  4e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  35.58 
 
 		 171 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4216  transcriptional regulator, TrmB  34.97 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.141181  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  32.89 
 
 		 472 aa  54.7  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3245  transcriptional regulator, ArsR family  24.83 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3269  ArsR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574198  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3009  ArsR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 207 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2946  ArsR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 207 aa  52  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.958799  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2973  putative transcriptional regulator  30.86 
 
 		 207 aa  52  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226444  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3255  transcriptional regulator, ArsR family  24.14 
 
 		 207 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3257  ArsR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 207 aa  51.6  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3024  ArsR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 207 aa  51.6  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7611  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 185 aa  51.2  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  35 
 
 		 211 aa  51.2  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 120 aa  50.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1905  putative transcriptional regulator  38.64 
 
 		 176 aa  50.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  36.51 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1887  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.040626 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4756  transcriptional regulator, ArsR family  27.38 
 
 		 150 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00171627  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  32.43 
 
 		 226 aa  48.5  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0045  transcriptional regulator, ArsR family  29.17 
 
 		 142 aa  48.1  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0248  regulatory protein ArsR  38.55 
 
 		 109 aa  48.1  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  27.38 
 
 		 113 aa  47.8  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3725  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 196 aa  48.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.833334  normal  0.384305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  30.3 
 
 		 213 aa  47.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  41.43 
 
 		 305 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0512  regulatory protein ArsR  31.3 
 
 		 124 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 		 305 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2552  ArsR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0674571  normal  0.191331 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  37.68 
 
 		 105 aa  46.6  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.82 
 
 		 243 aa  45.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8127  transcriptional regulator, ArsR family  34.57 
 
 		 209 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  40.35 
 
 		 216 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1047  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 194 aa  45.1  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  40.79 
 
 		 306 aa  45.1  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1111  putative transcriptional regulator  34.21 
 
 		 223 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0673626  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1497  transcriptional regulator  22.37 
 
 		 149 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1796  hypothetical protein  21.71 
 
 		 149 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2853  putative transcriptional regulator  34.09 
 
 		 193 aa  44.7  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  decreased coverage  0.00327558 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 118 aa  44.3  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1718  hypothetical protein  21.71 
 
 		 149 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0746  transcriptional regulator, ArsR family  35.94 
 
 		 210 aa  44.3  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1887  putative transcriptional regulatory protein  27.71 
 
 		 188 aa  44.3  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.471019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1739  hypothetical protein  22.37 
 
 		 149 aa  44.3  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0385114  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2260  transcriptional regulator, ArsR family  31.87 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.1059  normal  0.463419 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1651  hypothetical protein  21.71 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 307 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0618  regulatory protein, ArsR  34.38 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1532  hypothetical protein  21.71 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0607  hypothetical protein  34.78 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 		 120 aa  43.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0328  putative transcriptional regulator  34.38 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  31.76 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1606  transcriptional regulatory protein, putative  26.51 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00436475  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8435  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 355 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  27.27 
 
 		 210 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2846  transcriptional regulator, ArsR family  31.17 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.67 
 
 		 213 aa  42.4  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  34.72 
 
 		 110 aa  42.4  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  36.51 
 
 		 109 aa  42.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4017  regulatory protein, ArsR  30.67 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.94661  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1506  ArsR family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 149 aa  42  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0520742  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  32.39 
 
 		 183 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  34 
 
 		 98 aa  42  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1537  ArsR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 149 aa  42  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  39.22 
 
 		 230 aa  42  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 118 aa  42.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 116 aa  42  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 113 aa  42  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  30.95 
 
 		 212 aa  41.6  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  29.81 
 
 		 109 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  36.67 
 
 		 336 aa  41.6  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0866  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 		 104 aa  41.6  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.980203 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 192 aa  41.6  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2991  transcriptional regulator, ArsR family  27.43 
 
 		 184 aa  41.6  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 125 aa  41.2  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  29.52 
 
 		 180 aa  41.2  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0938  ArsR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 106 aa  41.2  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1526  putative transcriptional regulator  32.94 
 
 		 180 aa  40.8  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0109  ArsR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 197 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 118 aa  41.2  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 129 aa  40.8  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 		 121 aa  41.2  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  33.77 
 
 		 116 aa  40.8  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0660  ArsR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 96 aa  40.8  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410209  normal  0.0250069 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>