30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0850 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0850  Hyaluronate lyase  100 
 
 		 792 aa  1576    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3227  Hyaluronate lyase  37.04 
 
 		 1131 aa  458  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1698  hyaluronate lyase  35.07 
 
 		 793 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222511  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0390  polysaccharide lyase family protein 8  31.55 
 
 		 985 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.918566  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0394  polysaccharide lyase family protein 8  31.12 
 
 		 1003 aa  369  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4208  Hyaluronate lyase  36.3 
 
 		 753 aa  360  4e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.431721  hitchhiker  0.000853972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6725  Hyaluronate lyase  40.88 
 
 		 576 aa  347  7e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4980  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  32.6 
 
 		 797 aa  345  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00611188  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0352  hyaluronate lyase  29.22 
 
 		 791 aa  334  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1197  hyaluronate lyase  27.55 
 
 		 1072 aa  260  8e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4062  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  30.39 
 
 		 892 aa  246  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.505411  normal  0.685622 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0125  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  28.64 
 
 		 739 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2232  polysaccharide lyase family protein 8  26.04 
 
 		 809 aa  228  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2271  polysaccharide lyase family protein 8  26.04 
 
 		 809 aa  228  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0174  polysaccharide lyase 8 alpha-helical  29.1 
 
 		 846 aa  207  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0117  Hyaluronate lyase  25.1 
 
 		 618 aa  155  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0786  polysaccharide lyase family 8  26.01 
 
 		 700 aa  153  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4325  chondroitin AC lyase  28.06 
 
 		 693 aa  140  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3979  polysaccharide lyase family 8  25.25 
 
 		 718 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0500  polysaccharide lyase family 8  27.8 
 
 		 533 aa  108  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346359  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.68 
 
 		 929 aa  105  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7449  hypothetical protein  33.55 
 
 		 636 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3277  polysaccharide lyase family protein 8  23.27 
 
 		 1024 aa  68.6  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028263 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0997  lyase catalytic  24.4 
 
 		 1024 aa  67.8  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0946  polysaccharide lyase family protein 8  24.67 
 
 		 1024 aa  67.4  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2256  chondroitinase  29.97 
 
 		 1043 aa  60.1  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824242 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0932  polysaccharide lyase family protein 8  24.55 
 
 		 750 aa  59.7  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0363871  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0784  Lyase catalytic  23.08 
 
 		 1030 aa  60.1  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2838  Lyase catalytic  21.23 
 
 		 1077 aa  58.5  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102032 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3863  Chondroitin AC lyase  26.14 
 
 		 656 aa  51.6  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.569924  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>