More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0818 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
152 aa  308  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  63.45 
 
 
152 aa  190  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  62.07 
 
 
152 aa  187  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  53.47 
 
 
156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  53.85 
 
 
167 aa  158  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  52.74 
 
 
153 aa  154  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  46.15 
 
 
149 aa  126  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 
147 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 
153 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 
170 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.36 
 
 
158 aa  118  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 
170 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  42.36 
 
 
182 aa  114  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
153 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  43.36 
 
 
153 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  39.58 
 
 
158 aa  110  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 
170 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  42.66 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  40.69 
 
 
150 aa  108  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  37.59 
 
 
143 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  39.58 
 
 
149 aa  107  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  40.13 
 
 
152 aa  107  5e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  42.54 
 
 
136 aa  107  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  40.56 
 
 
156 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 
150 aa  106  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 
161 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2378  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 
168 aa  104  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258345  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  41.96 
 
 
152 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2259  AsnC/Lrp family regulatory protein  39.58 
 
 
165 aa  102  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25142  normal  0.0557918 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 
156 aa  102  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  41.1 
 
 
167 aa  100  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  39.04 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  36.11 
 
 
155 aa  98.6  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  37.19 
 
 
162 aa  98.2  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  39.73 
 
 
152 aa  97.4  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  40.15 
 
 
149 aa  97.4  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2696  transcriptional regulator, AsnC family  40.85 
 
 
161 aa  97.4  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  36.5 
 
 
151 aa  96.7  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  39.72 
 
 
196 aa  96.3  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2239  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 
162 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14050  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 
156 aa  96.3  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00148538  normal  0.352313 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  37.93 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0586  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 
182 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1065  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 
182 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  34.44 
 
 
174 aa  95.9  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 
162 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  35.97 
 
 
162 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0945  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 
182 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962352  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 
150 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.12 
 
 
153 aa  95.1  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  35.97 
 
 
162 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0941  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 
182 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344592  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  35.97 
 
 
162 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  35.97 
 
 
162 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1024  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 
182 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  39.42 
 
 
145 aa  94.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  35.97 
 
 
162 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
186 aa  94.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  33.56 
 
 
157 aa  94.7  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  35.97 
 
 
162 aa  94.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0112  transcriptional regulator, AsnC family  34.75 
 
 
153 aa  94.7  4e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2924  leucine-responsive regulatory protein  35.97 
 
 
162 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2863  leucine-responsive regulatory protein  35.97 
 
 
162 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437935  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 
174 aa  94.4  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9337  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.28 
 
 
153 aa  94.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2044  transcriptional regulator, AsnC family  34.51 
 
 
158 aa  94  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549903  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  31.97 
 
 
156 aa  94  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  35.97 
 
 
164 aa  94.4  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  34.53 
 
 
162 aa  94  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  34.31 
 
 
174 aa  94  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  40.58 
 
 
162 aa  94.4  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  35.76 
 
 
155 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  35.97 
 
 
164 aa  94  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.42 
 
 
160 aa  94  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1187  leucine-responsive transcriptional regulator  35.25 
 
 
158 aa  94  7e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  35.76 
 
 
155 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  35.97 
 
 
164 aa  94  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4179  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 
162 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401233  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  35.97 
 
 
164 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 
181 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  38.69 
 
 
148 aa  93.6  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0022  transcriptional regulator, AsnC family  37.32 
 
 
164 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 
174 aa  92.8  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.12 
 
 
152 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  35.97 
 
 
164 aa  92  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  35.97 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  35.97 
 
 
164 aa  92  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.12 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  35.97 
 
 
164 aa  92  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  35.97 
 
 
164 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.12 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  35.97 
 
 
164 aa  92  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1396  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
174 aa  92.8  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.12 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  37.96 
 
 
154 aa  92.8  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  35.97 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  35.97 
 
 
164 aa  92  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  35.97 
 
 
164 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 
168 aa  92.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>