More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0796 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 1033 aa  2034    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  49.2 
 
 		 995 aa  839    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  44.61 
 
 		 1001 aa  634  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  41.4 
 
 		 1003 aa  635  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  42.05 
 
 		 1014 aa  632  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  41.46 
 
 		 1010 aa  618  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  36.73 
 
 		 1027 aa  570  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  39.78 
 
 		 1003 aa  571  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  40.9 
 
 		 990 aa  570  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  38.35 
 
 		 983 aa  538  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 1071 aa  385  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  40.72 
 
 		 1030 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  34.13 
 
 		 1088 aa  368  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  40.78 
 
 		 1025 aa  351  5e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  38.28 
 
 		 919 aa  349  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  32.68 
 
 		 1020 aa  341  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  36.21 
 
 		 992 aa  330  7e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  40.17 
 
 		 930 aa  328  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  36.96 
 
 		 1022 aa  327  7e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  31.58 
 
 		 934 aa  322  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  39.12 
 
 		 990 aa  321  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  29.7 
 
 		 996 aa  318  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  38.99 
 
 		 921 aa  316  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  34.7 
 
 		 931 aa  311  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  39.84 
 
 		 940 aa  309  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 1048 aa  307  6e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  38.62 
 
 		 1054 aa  307  6e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  30.78 
 
 		 1017 aa  306  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  38.04 
 
 		 981 aa  306  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  34.02 
 
 		 928 aa  303  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  37.89 
 
 		 946 aa  300  8e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  36.24 
 
 		 993 aa  300  9e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  36.28 
 
 		 1108 aa  297  6e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  37.48 
 
 		 956 aa  294  7e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  37.58 
 
 		 908 aa  294  7e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  36.32 
 
 		 907 aa  293  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.5 
 
 		 921 aa  291  3e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  31.49 
 
 		 1022 aa  291  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  38.86 
 
 		 1003 aa  291  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  36.79 
 
 		 965 aa  290  8e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  37.12 
 
 		 993 aa  290  9e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  34.97 
 
 		 970 aa  286  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  32.49 
 
 		 915 aa  285  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  36.12 
 
 		 954 aa  284  7.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  34.42 
 
 		 967 aa  283  8.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  37.9 
 
 		 965 aa  283  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  35.15 
 
 		 1011 aa  279  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  40.25 
 
 		 496 aa  275  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  37 
 
 		 928 aa  275  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 654 aa  270  8e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  34.31 
 
 		 982 aa  270  8.999999999999999e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  35.15 
 
 		 913 aa  267  8e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  37.61 
 
 		 1138 aa  266  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  36.85 
 
 		 1025 aa  265  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  37.91 
 
 		 950 aa  264  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  36.26 
 
 		 964 aa  261  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  37.93 
 
 		 621 aa  259  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  32.58 
 
 		 788 aa  258  4e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  36.19 
 
 		 989 aa  257  9e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  34.55 
 
 		 992 aa  256  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  38.25 
 
 		 971 aa  256  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  33.42 
 
 		 790 aa  254  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  42.45 
 
 		 850 aa  250  8e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  41.98 
 
 		 453 aa  249  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  36.17 
 
 		 963 aa  249  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  32.1 
 
 		 797 aa  248  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  36.09 
 
 		 962 aa  246  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  29.68 
 
 		 1008 aa  246  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  35.77 
 
 		 941 aa  242  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  37.3 
 
 		 1021 aa  242  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  34.84 
 
 		 1034 aa  241  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  35.74 
 
 		 612 aa  239  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  36.72 
 
 		 910 aa  238  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  38.04 
 
 		 1024 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  36.47 
 
 		 935 aa  236  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  31.06 
 
 		 1013 aa  232  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  38.58 
 
 		 806 aa  232  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  33.92 
 
 		 981 aa  233  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  43.59 
 
 		 715 aa  231  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  43.62 
 
 		 814 aa  231  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  36.66 
 
 		 910 aa  229  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  39.17 
 
 		 755 aa  228  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 1346 aa  227  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  34.69 
 
 		 775 aa  227  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  35.57 
 
 		 978 aa  226  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 1319 aa  224  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  34.53 
 
 		 937 aa  224  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 621 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  36.68 
 
 		 926 aa  222  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  32.32 
 
 		 1030 aa  221  7.999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  33.23 
 
 		 775 aa  218  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  37.82 
 
 		 582 aa  218  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  32.61 
 
 		 632 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  37.58 
 
 		 757 aa  211  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  36.92 
 
 		 994 aa  211  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  32.28 
 
 		 915 aa  202  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  39.89 
 
 		 1004 aa  202  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.22 
 
 		 742 aa  202  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  37.67 
 
 		 838 aa  200  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 622 aa  199  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>