35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0664 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0664  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 		 470 aa  944    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1713  glycoside hydrolase family protein  61.68 
 
 		 472 aa  533  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3558  endoglycoceramidase  33.05 
 
 		 490 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5206  glycoside hydrolase family protein  29.57 
 
 		 553 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253105  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5653  glycoside hydrolase family protein  29.57 
 
 		 553 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227096  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2260  glycoside hydrolase family 5  28.54 
 
 		 410 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.445359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1364  glycoside hydrolase family 5  30.4 
 
 		 618 aa  97.1  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00194405  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5302  hypothetical protein  30.84 
 
 		 632 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00149118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6164  glycoside hydrolase family 5  26.11 
 
 		 612 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791591  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0370  glycoside hydrolase family 5  25.42 
 
 		 661 aa  81.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.674387  normal  0.0657356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  25.75 
 
 		 869 aa  62.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  25 
 
 		 551 aa  61.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0833  hypothetical protein  29.35 
 
 		 656 aa  59.3  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.982432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  23.94 
 
 		 493 aa  57.8  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  23.67 
 
 		 814 aa  57.8  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  26.76 
 
 		 573 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06030  cytoplasm protein, putative  23.2 
 
 		 742 aa  54.7  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749015  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03013  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08820)  22.36 
 
 		 763 aa  54.7  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  27 
 
 		 601 aa  53.9  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02490  cytoplasm protein, putative  23.71 
 
 		 851 aa  52  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  28.57 
 
 		 853 aa  51.6  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  24.18 
 
 		 468 aa  50.1  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55209  predicted protein  21.88 
 
 		 912 aa  50.1  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  25.37 
 
 		 349 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1694  glycosidase, family 5  20.72 
 
 		 436 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000120172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  25.87 
 
 		 501 aa  49.7  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  22.63 
 
 		 489 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3335  Cellulase  23.03 
 
 		 578 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59527  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  24.17 
 
 		 456 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3539  glycosidase, family 5  20 
 
 		 422 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  24.17 
 
 		 411 aa  45.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2829  Beta-galactosidase  44.23 
 
 		 714 aa  44.7  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.130721  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  24.79 
 
 		 863 aa  43.9  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  23.39 
 
 		 377 aa  43.9  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4499  Cellulase  23.88 
 
 		 349 aa  43.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>