More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0640 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
572 aa  1144    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  43.97 
 
 
639 aa  416  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  40.74 
 
 
724 aa  415  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6438  hypothetical protein  40.39 
 
 
680 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.541051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5076  hypothetical protein  53.43 
 
 
736 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0262  Hemolysin-type calcium-binding region  41.1 
 
 
729 aa  294  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  43.09 
 
 
742 aa  257  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4310  Hemolysin-type calcium-binding region  37.39 
 
 
620 aa  229  9e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  37.22 
 
 
728 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5021  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  32.67 
 
 
717 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.63904  normal  0.0614603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2300  hypothetical protein  35.79 
 
 
739 aa  154  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.259939  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  47.77 
 
 
2885 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  50.77 
 
 
2667 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50.77 
 
 
1236 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.53 
 
 
3427 aa  116  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  42.53 
 
 
1424 aa  114  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  44.16 
 
 
813 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  42.53 
 
 
3619 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  37.67 
 
 
1164 aa  111  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  42.53 
 
 
3619 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  46.39 
 
 
950 aa  110  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  44.58 
 
 
980 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  50.36 
 
 
2954 aa  109  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.79 
 
 
1963 aa  107  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  41.71 
 
 
606 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  42.42 
 
 
795 aa  106  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  45.51 
 
 
1400 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  46.53 
 
 
1534 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.67 
 
 
588 aa  105  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  45.21 
 
 
387 aa  104  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  39.76 
 
 
709 aa  104  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  46.51 
 
 
615 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  48.57 
 
 
679 aa  103  9e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  45.21 
 
 
2105 aa  103  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  47.1 
 
 
982 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  44.06 
 
 
1287 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  44.44 
 
 
232 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  47.44 
 
 
1895 aa  102  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  48.18 
 
 
946 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  45.95 
 
 
686 aa  102  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  35.97 
 
 
4798 aa  101  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40 
 
 
1795 aa  101  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  43.88 
 
 
833 aa  101  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  38.1 
 
 
3608 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  45.62 
 
 
280 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  40.4 
 
 
3954 aa  100  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  48.06 
 
 
260 aa  100  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  41.88 
 
 
491 aa  100  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  40.98 
 
 
757 aa  99.8  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  40.24 
 
 
1279 aa  99.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  34.54 
 
 
1532 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  43.36 
 
 
526 aa  99  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  40.18 
 
 
518 aa  99  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  47.01 
 
 
2668 aa  99  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  45 
 
 
280 aa  98.6  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  48.36 
 
 
867 aa  98.6  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  46.03 
 
 
219 aa  98.6  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  46.15 
 
 
582 aa  98.2  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  46.43 
 
 
585 aa  97.8  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  45.52 
 
 
460 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  48.41 
 
 
938 aa  97.1  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.87 
 
 
421 aa  97.1  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  44.16 
 
 
4334 aa  96.3  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  39.08 
 
 
850 aa  96.3  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  45.26 
 
 
744 aa  96.7  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  40.85 
 
 
613 aa  96.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  41.78 
 
 
686 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 
589 aa  95.9  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  37.13 
 
 
824 aa  95.5  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  41.18 
 
 
2145 aa  95.5  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  38.27 
 
 
361 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  48.2 
 
 
595 aa  95.9  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  46.15 
 
 
1363 aa  95.1  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  49.14 
 
 
202 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  46.83 
 
 
219 aa  93.2  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  49.14 
 
 
202 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  43.45 
 
 
396 aa  93.6  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0082  type I secretion target repeat-containing protein  43.06 
 
 
355 aa  92.8  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  46.9 
 
 
1175 aa  92.8  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  41.38 
 
 
2911 aa  92.8  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  39.08 
 
 
734 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 
1022 aa  92.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 
1017 aa  92.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  44.83 
 
 
1526 aa  91.7  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  51.16 
 
 
2775 aa  91.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  44.65 
 
 
4800 aa  91.3  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  39.89 
 
 
424 aa  91.7  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  41.77 
 
 
385 aa  91.3  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  46.03 
 
 
303 aa  91.3  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  38.3 
 
 
741 aa  91.3  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  45.58 
 
 
1544 aa  91.3  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  51.16 
 
 
1712 aa  90.9  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  43.36 
 
 
327 aa  90.9  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  50 
 
 
1594 aa  90.5  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  43.08 
 
 
9867 aa  90.5  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  38.31 
 
 
243 aa  90.1  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  37.44 
 
 
437 aa  90.1  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.31 
 
 
485 aa  90.1  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.5 
 
 
1016 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  51.52 
 
 
2678 aa  88.6  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>