More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0557 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0557  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 
369 aa  746    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6132  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0422  phosphoserine aminotransferase  68.83 
 
 
417 aa  506  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0510  phosphoserine aminotransferase  68.27 
 
 
375 aa  504  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00655495  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1004  Phosphoserine aminotransferase-like protein  65.14 
 
 
369 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0832  phosphoserine aminotransferase  63.78 
 
 
370 aa  489  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.588102  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0519  phosphoserine aminotransferase  64.86 
 
 
370 aa  486  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.300823  normal  0.0573772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4171  phosphoserine aminotransferase  64.86 
 
 
376 aa  484  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309749  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0246  phosphoserine aminotransferase  62.37 
 
 
373 aa  478  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132433  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0114  phosphoserine aminotransferase  63.51 
 
 
377 aa  481  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1718  phosphoserine aminotransferase  61.41 
 
 
395 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017199  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10901  phosphoserine aminotransferase  60.33 
 
 
376 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0847  phosphoserine aminotransferase  60.05 
 
 
374 aa  458  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4709  phosphoserine aminotransferase  60.8 
 
 
375 aa  457  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33860  phosphoserine aminotransferase  60 
 
 
376 aa  457  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8790  phosphoserine aminotransferase  59.95 
 
 
373 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0793  phosphoserine aminotransferase  62.33 
 
 
376 aa  457  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5033  phosphoserine aminotransferase  60.98 
 
 
371 aa  454  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621605  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0829  phosphoserine aminotransferase  61.14 
 
 
370 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726132  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0910  phosphoserine aminotransferase  61.79 
 
 
376 aa  450  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.412993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0514  phosphoserine aminotransferase  60.11 
 
 
377 aa  450  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238654  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7228  phosphoserine aminotransferase  60.7 
 
 
374 aa  445  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04180  phosphoserine aminotransferase  61.19 
 
 
375 aa  444  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305971  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4847  phosphoserine aminotransferase  59.84 
 
 
370 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599568  normal  0.0428667 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0082  phosphoserine aminotransferase  59.73 
 
 
374 aa  431  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4464  phosphoserine aminotransferase  59.84 
 
 
370 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0730  phosphoserine aminotransferase  62.43 
 
 
374 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.835116  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4551  phosphoserine aminotransferase  59.84 
 
 
370 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.413402  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1258  phosphoserine aminotransferase  58.4 
 
 
381 aa  430  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0771  phosphoserine aminotransferase  60.32 
 
 
393 aa  425  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30790  phosphoserine aminotransferase  60.11 
 
 
378 aa  422  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.514499  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2846  phosphoserine aminotransferase  58.67 
 
 
379 aa  410  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0325  phosphoserine aminotransferase  57.26 
 
 
372 aa  404  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0459701 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3591  phosphoserine aminotransferase  58.97 
 
 
385 aa  400  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.465609  normal  0.244351 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1990  phosphoserine aminotransferase  54.1 
 
 
372 aa  400  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0880  phosphoserine aminotransferase  59.13 
 
 
378 aa  392  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00411134  normal  0.22946 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1532  phosphoserine aminotransferase  52.19 
 
 
382 aa  387  1e-106  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13530  phosphoserine aminotransferase  51.9 
 
 
387 aa  384  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39837  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1783  phosphoserine aminotransferase  49.47 
 
 
380 aa  367  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0020  aminotransferase class V  43.17 
 
 
373 aa  275  8e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0711  phosphoserine transaminase  30.15 
 
 
383 aa  140  3e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000109089 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2434  aminotransferase class V  28.33 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1381  phosphoserine aminotransferase  26.72 
 
 
391 aa  93.6  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.705513 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1759  phosphoserine aminotransferase  26.81 
 
 
390 aa  93.6  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0555  phosphoserine aminotransferase  28.89 
 
 
410 aa  93.6  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6961  phosphoserine aminotransferase  28.23 
 
 
399 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0260  phosphoserine aminotransferase  28.73 
 
 
389 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2704  phosphoserine aminotransferase  24.03 
 
 
346 aa  88.6  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0019  phosphoserine aminotransferase  27.01 
 
 
385 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.625481  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1351  phosphoserine aminotransferase  26.75 
 
 
385 aa  87  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0670  phosphoserine aminotransferase  28.69 
 
 
391 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.786402  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4468  phosphoserine aminotransferase  25.72 
 
 
395 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0805419  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0659  phosphoserine aminotransferase  28.69 
 
 
391 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.381901 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  27.23 
 
 
375 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1270  phosphoserine aminotransferase  27.06 
 
 
390 aa  84  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.722575  normal  0.0220026 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5460  phosphoserine aminotransferase  28.11 
 
 
385 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0617  phosphoserine aminotransferase  28.01 
 
 
376 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3317  phosphoserine aminotransferase  27.27 
 
 
384 aa  82.8  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.904643 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0009  phosphoserine aminotransferase  26.86 
 
 
385 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00470966 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0477  phosphoserine aminotransferase  27.39 
 
 
393 aa  82.8  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108745 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4686  phosphoserine aminotransferase  27.18 
 
 
385 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0966475  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1203  phosphoserine aminotransferase  24.84 
 
 
391 aa  82  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.509685  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2679  phosphoserine aminotransferase  26.76 
 
 
379 aa  81.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0638  phosphoserine aminotransferase  26.22 
 
 
391 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.612941  normal  0.204061 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  23.89 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2651  phosphoserine aminotransferase  26.84 
 
 
396 aa  80.1  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.311061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1073  aminotransferase class V  24.93 
 
 
363 aa  79.7  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.662635  normal  0.844475 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3596  phosphoserine aminotransferase  26.46 
 
 
392 aa  79.7  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4691  aminotransferase class V  25.78 
 
 
357 aa  79.3  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439088  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3625  phosphoserine aminotransferase  27.96 
 
 
389 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0111727 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0995  phosphoserine aminotransferase  23.18 
 
 
361 aa  79.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  24.93 
 
 
358 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0295  phosphoserine aminotransferase  26.13 
 
 
372 aa  79  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000953711  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1687  phosphoserine aminotransferase  25.27 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3162  phosphoserine aminotransferase  26.54 
 
 
390 aa  78.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  24.93 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1631  phosphoserine aminotransferase  26.01 
 
 
391 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2000  phosphoserine aminotransferase  26.37 
 
 
361 aa  77  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.572206  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3646  phosphoserine aminotransferase  24.1 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153815  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1088  Alanine--glyoxylate transaminase  27.3 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110462  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1825  phosphoserine aminotransferase  26.84 
 
 
390 aa  76.6  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1228  phosphoserine aminotransferase  25.81 
 
 
391 aa  76.3  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.858979  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1171  phosphoserine aminotransferase  25.45 
 
 
392 aa  76.3  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0861672  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4790  phosphoserine aminotransferase  26.13 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1332  phosphoserine aminotransferase  24.09 
 
 
371 aa  75.1  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3020  phosphoserine aminotransferase  26.24 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23270  phosphoserine aminotransferase  25.55 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0156292 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0508  phosphoserine aminotransferase  25.41 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.957618  normal  0.349025 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3023  phosphoserine aminotransferase  23.9 
 
 
360 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1314  phosphoserine aminotransferase  26.17 
 
 
390 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1857  phosphoserine aminotransferase  23.98 
 
 
354 aa  73.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.729123  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3261  phosphoserine aminotransferase  23.9 
 
 
360 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3299  phosphoserine aminotransferase  23.9 
 
 
360 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1732  phosphoserine aminotransferase  25 
 
 
361 aa  73.2  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1768  phosphoserine aminotransferase  24.11 
 
 
361 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0882462  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2137  phosphoserine aminotransferase  24.47 
 
 
390 aa  73.2  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1118  phosphoserine aminotransferase  25.79 
 
 
390 aa  73.2  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.837238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2969  phosphoserine aminotransferase  23.55 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1375  phosphoserine aminotransferase  24.55 
 
 
335 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1294  phosphoserine aminotransferase  24.87 
 
 
370 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.303177  normal  0.291609 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2969  phosphoserine aminotransferase  25.6 
 
 
390 aa  72  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>