More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0526 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0526  ABC transporter related protein  100 
 
 
328 aa  663    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2522  ABC transporter related  51.86 
 
 
336 aa  375  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1832  ABC transporter related  55.38 
 
 
335 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2385  ABC transporter related  52.65 
 
 
320 aa  334  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6487  ABC transporter related  55.08 
 
 
317 aa  323  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0112869  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0486  ABC transporter related  46.25 
 
 
334 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0175  ABC transporter, ATP-binding protein  43.92 
 
 
341 aa  319  3e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0172  ABC transporter, ATP-binding protein  43.92 
 
 
341 aa  319  3.9999999999999996e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0978  ABC transporter related  46.32 
 
 
342 aa  318  6e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2220  ABC transporter related  46.6 
 
 
333 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.580066  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2519  ABC transporter related  46.3 
 
 
333 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.791521  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0515  ABC transporter, ATP-binding protein  45.59 
 
 
337 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00155864 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0587  ABC transporter, ATP-binding protein  45.59 
 
 
337 aa  310  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0500  ABC transporter ATP-binding protein  45.59 
 
 
337 aa  310  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0443  ABC transporter, ATP-binding protein  45.59 
 
 
337 aa  310  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0439  ABC transporter, ATP-binding protein  45.59 
 
 
337 aa  310  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0588  ABC transporter, ATP-binding protein  45.59 
 
 
337 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0532  ABC transporter ATP-binding protein  45.59 
 
 
337 aa  310  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0434  ABC transporter related  44.58 
 
 
336 aa  310  2.9999999999999997e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0448  ABC transporter related  45.29 
 
 
337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4789  ABC transporter, ATP-binding protein  45.29 
 
 
337 aa  309  5e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0670413  hitchhiker  0.00137355 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0537  ABC transporter, ATP-binding protein  45.29 
 
 
337 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1920  ABC transporter related  53.95 
 
 
324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567782  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4781  ABC transporter related protein  52.38 
 
 
330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.975884 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1358  ABC transporter related protein  46.06 
 
 
334 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0454  ABC transporter-related protein  43.5 
 
 
337 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2493  ABC transporter related protein  54.86 
 
 
318 aa  301  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000144687  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4151  ABC transporter related protein  45.51 
 
 
321 aa  298  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0325933 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2673  ABC transporter related  43.3 
 
 
324 aa  296  3e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0190306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0444  ABC transporter related  43.61 
 
 
324 aa  289  4e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3919  ABC transporter related protein  46.88 
 
 
318 aa  289  5.0000000000000004e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4689  ABC transporter related  45.26 
 
 
331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3153  ABC transporter related  46.51 
 
 
323 aa  286  4e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148075  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09750  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  50.53 
 
 
342 aa  281  1e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2515  ABC transporter related  42.9 
 
 
324 aa  280  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0660  ABC transporter related  45.31 
 
 
337 aa  280  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  hitchhiker  0.000000264016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3436  ABC transporter, ATP-binding protein  59.03 
 
 
254 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.352902 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0432  ABC transporter-related protein  43.08 
 
 
334 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12840  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  44.02 
 
 
341 aa  275  6e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4137  ABC transporter related  48.95 
 
 
326 aa  274  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0433  ABC transporter related  42.77 
 
 
334 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0404  ABC transporter, ATPase subunit  42.46 
 
 
334 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3780  ABC transporter related  52.26 
 
 
265 aa  271  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000137492  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1284  ABC transporter related  43.09 
 
 
329 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.980121 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0659  ABC transporter, ATP-binding protein  39.26 
 
 
330 aa  267  2e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1189  ABC transporter related protein  42.9 
 
 
322 aa  267  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0487  ABC transporter, ATP-binding protein  51.64 
 
 
261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.139587  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3407  ABC transporter related  41.09 
 
 
336 aa  265  5.999999999999999e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.205192 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1396  ABC transporter related protein  40.25 
 
 
331 aa  264  1e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0425  ABC transporter related protein  38.92 
 
 
339 aa  263  3e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0547  ABC transporter related  44.71 
 
 
333 aa  263  4e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.757671  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3863  ABC transporter related  39.57 
 
 
329 aa  263  4e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2497  ABC transporter related  42.64 
 
 
328 aa  262  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.946851  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1441  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
326 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2057  ABC transporter related  38.48 
 
 
329 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2031  ABC transporter related  38.25 
 
 
329 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0911  ABC transporter related protein  38.27 
 
 
329 aa  260  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08570  ABC transporter related  44.88 
 
 
262 aa  257  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5809  ABC transporter related  50.61 
 
 
292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1069  ABC transporter related  48.34 
 
 
285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2891  ABC transporter-like protein  41.88 
 
 
330 aa  252  5.000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2682  ABC transporter-like  40.25 
 
 
326 aa  252  6e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.241225  normal  0.53563 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1128  ABC transporter related  36.42 
 
 
328 aa  252  6e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0395401  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2818  ABC transporter related protein  40.18 
 
 
333 aa  252  8.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.700865  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2319  ABC transporter related protein  42.28 
 
 
323 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1759  ABC transporter-like protein protein  39.94 
 
 
326 aa  251  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.984007  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0178  ATPase  41.05 
 
 
325 aa  251  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.604425  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1966  ABC transporter related  40.68 
 
 
324 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000391335  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2557  ATPase  40.31 
 
 
324 aa  248  8e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2350  ABC transporter related  37.61 
 
 
324 aa  246  4e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2211  ATPase  40 
 
 
328 aa  245  8e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4166  ABC transporter related  40.18 
 
 
332 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675613  normal  0.359967 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2073  ABC transporter-related protein  46.43 
 
 
276 aa  239  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111987  normal  0.868445 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29121  putative multidrug efflux ABC transporter  39.01 
 
 
331 aa  239  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3395  ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 
338 aa  237  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.109056  hitchhiker  0.000000258754 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  36.39 
 
 
329 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2410  ABC transporter related  38.99 
 
 
332 aa  233  5e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  35.38 
 
 
331 aa  232  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.110589  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0550  ABC transporter-like protein  38.96 
 
 
328 aa  231  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0536  ABC transporter related protein  38.96 
 
 
328 aa  231  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  35.08 
 
 
331 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0981  ATPase  34.86 
 
 
331 aa  225  9e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425969  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09011  putative multidrug efflux ABC transporter  36.53 
 
 
332 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266178 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0234  ATPase  36.53 
 
 
332 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.822297  n/a   
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1507  ABC transporter related protein  45.5 
 
 
314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  decreased coverage  0.000000000014489  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0893  ABC transporter, ATP-binding protein  31.33 
 
 
343 aa  198  9e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0136  ABC transporter related protein  42.92 
 
 
314 aa  187  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2651  ABC transporter, ATP-binding protein  28.05 
 
 
329 aa  177  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3566  ABC transporter related  37.89 
 
 
302 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.45 
 
 
328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0785  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.84 
 
 
324 aa  159  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3319  ABC transporter related  40.28 
 
 
332 aa  159  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0789  ABC transporter related  36.36 
 
 
360 aa  157  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.34 
 
 
328 aa  157  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.58 
 
 
324 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0040  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.6 
 
 
321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.82 
 
 
325 aa  156  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5171  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.68 
 
 
329 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3883  ABC transporter related  37.34 
 
 
321 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.151879 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  37.78 
 
 
282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>