More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0467 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0467  beta-lactamase  100 
 
 		 381 aa  778    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  decreased coverage  0.000353045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4644  alkaline D-peptidase  50.27 
 
 		 397 aa  363  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00635481  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5597  beta-lactamase  47.35 
 
 		 406 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2565  beta-lactamase  45.58 
 
 		 378 aa  298  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129252  normal  0.077085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8159  alkaline D-peptidase  44.06 
 
 		 375 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.533807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  42.86 
 
 		 392 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  36.54 
 
 		 720 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  35.21 
 
 		 443 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  33.24 
 
 		 388 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  33.24 
 
 		 388 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  32.94 
 
 		 388 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  33.24 
 
 		 388 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  32.94 
 
 		 388 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  33.04 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  34.04 
 
 		 407 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  33.33 
 
 		 388 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.04 
 
 		 389 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  33.33 
 
 		 388 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  33.33 
 
 		 388 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  32.44 
 
 		 375 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.44 
 
 		 385 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.44 
 
 		 385 aa  169  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.04 
 
 		 389 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  33.13 
 
 		 407 aa  169  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  32.74 
 
 		 385 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  33.63 
 
 		 389 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  32.75 
 
 		 389 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.3 
 
 		 388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  32.83 
 
 		 385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  31.85 
 
 		 388 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  32.92 
 
 		 388 aa  162  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  32.44 
 
 		 388 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.14 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  32.29 
 
 		 388 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23940  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  38.73 
 
 		 378 aa  159  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0755223  normal  0.0888544 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.56 
 
 		 399 aa  158  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  34.78 
 
 		 429 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3984  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  36.42 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6210  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  34.73 
 
 		 391 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0504  beta-lactamase  34.88 
 
 		 409 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.35102  hitchhiker  0.00000257291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.89 
 
 		 416 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0398  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.5 
 
 		 366 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  37.5 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4727  beta-lactamase  33.44 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  31.81 
 
 		 374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  33.33 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  32.65 
 
 		 370 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  37.44 
 
 		 420 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  32.42 
 
 		 349 aa  127  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4689  beta-lactamase  33.11 
 
 		 374 aa  126  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0791767  normal  0.116144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4155  beta-lactamase  28.49 
 
 		 378 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.15208 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1134  beta-lactamase  32.37 
 
 		 459 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2043  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.12 
 
 		 421 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4691  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.09 
 
 		 383 aa  123  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4690  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.38 
 
 		 379 aa  122  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00394326  normal  0.37742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4765  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.46 
 
 		 514 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.263187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5142  alkaline D-peptidase  31.85 
 
 		 428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00324654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.11 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  32 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  28.93 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1771  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.23 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.1791 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3352  beta-lactamase  33.18 
 
 		 416 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2416  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.09 
 
 		 411 aa  110  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758876  normal  0.129808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3468  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.01 
 
 		 415 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560934  normal  0.0158413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.5 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4687  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.69 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3986  hypothetical protein  29.04 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  29.77 
 
 		 740 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  28.29 
 
 		 380 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2647  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.97 
 
 		 429 aa  103  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.180779  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2538  beta-lactamase  29.21 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  24.48 
 
 		 487 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  25.32 
 
 		 510 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2114  hypothetical protein  36.11 
 
 		 213 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.321684  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6304  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.25 
 
 		 420 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397924  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0606  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.2 
 
 		 438 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  28.85 
 
 		 713 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6825  beta-lactamase  33.33 
 
 		 382 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6008  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.94 
 
 		 420 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960624  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.82 
 
 		 413 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1072  Beta-lactamase  27.37 
 
 		 412 aa  98.6  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  27.3 
 
 		 371 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  28.63 
 
 		 482 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  28.03 
 
 		 467 aa  97.1  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  28.63 
 
 		 482 aa  96.7  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3061  beta-lactamase  29.9 
 
 		 351 aa  96.3  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.502148  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  30.74 
 
 		 409 aa  96.3  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  26.67 
 
 		 371 aa  95.9  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  29.58 
 
 		 477 aa  95.5  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  28.05 
 
 		 449 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4325  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.65 
 
 		 405 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248121  normal  0.0483573 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7182  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.44 
 
 		 420 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0226696 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1263  beta-lactamase  27.42 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0172767 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0275  beta-lactamase  29.16 
 
 		 400 aa  94.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.35061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3281  beta-lactamase  30.35 
 
 		 414 aa  94  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.916487  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  30.66 
 
 		 470 aa  94  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  27.2 
 
 		 475 aa  93.2  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5738  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.72 
 
 		 447 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.38713 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4094  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.65 
 
 		 405 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4170  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.65 
 
 		 405 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>