More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0457 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  100 
 
 
487 aa  983    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  38.83 
 
 
494 aa  277  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  39.04 
 
 
656 aa  276  5e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3350  phage integrase  36.27 
 
 
508 aa  226  8e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292325  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3388  phage integrase  36.27 
 
 
508 aa  226  8e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  34.33 
 
 
463 aa  188  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3446  integrase family protein  33.12 
 
 
492 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  34.22 
 
 
404 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3464  integrase family protein  36.15 
 
 
377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  32.8 
 
 
409 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3454  integrase family protein  41.64 
 
 
337 aa  152  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  33.59 
 
 
377 aa  151  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  34.23 
 
 
477 aa  150  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  33.03 
 
 
387 aa  146  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  28.54 
 
 
370 aa  146  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  32.56 
 
 
403 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  32.67 
 
 
422 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  30.43 
 
 
431 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  26.17 
 
 
370 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  33.43 
 
 
414 aa  141  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  27.34 
 
 
373 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  33.33 
 
 
402 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  31.05 
 
 
435 aa  136  9e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  31.02 
 
 
422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  30.27 
 
 
442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  29.46 
 
 
378 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  27.61 
 
 
388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.91 
 
 
374 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.91 
 
 
374 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  30.29 
 
 
386 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  28.97 
 
 
379 aa  133  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  29.09 
 
 
390 aa  132  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  27.41 
 
 
391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  33.43 
 
 
377 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  26.49 
 
 
378 aa  130  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  32.31 
 
 
383 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  28.57 
 
 
325 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  38.61 
 
 
393 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  26.34 
 
 
392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  28.17 
 
 
381 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  27.71 
 
 
392 aa  123  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  27.03 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  39.23 
 
 
378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  29.4 
 
 
379 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  29.77 
 
 
305 aa  121  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  29.4 
 
 
379 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  31.4 
 
 
383 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  30.84 
 
 
368 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  29.71 
 
 
363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  28.35 
 
 
416 aa  118  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  28.07 
 
 
416 aa  117  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  27.44 
 
 
367 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  26.3 
 
 
370 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  31.19 
 
 
371 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  27.17 
 
 
389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  23.9 
 
 
369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  30.42 
 
 
385 aa  114  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  35.65 
 
 
471 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  35.5 
 
 
471 aa  114  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  27.85 
 
 
437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  33.06 
 
 
426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  27.35 
 
 
506 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  23.12 
 
 
369 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  29.73 
 
 
391 aa  110  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  24.93 
 
 
400 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  22.86 
 
 
369 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  26.43 
 
 
413 aa  103  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  24.63 
 
 
451 aa  100  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  28.41 
 
 
406 aa  98.2  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  30.45 
 
 
374 aa  95.9  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  23.6 
 
 
381 aa  94.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  25.62 
 
 
384 aa  94.7  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  27.99 
 
 
407 aa  94.4  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  25.07 
 
 
443 aa  92.8  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  34.69 
 
 
201 aa  93.2  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  25.49 
 
 
443 aa  92  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  28.62 
 
 
387 aa  92  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  28.36 
 
 
357 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  23.44 
 
 
386 aa  90.5  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0878  phage integrase  40.13 
 
 
429 aa  90.1  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  22.98 
 
 
381 aa  89  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  29.17 
 
 
209 aa  87.8  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  27.59 
 
 
385 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0388  hypothetical protein  52.44 
 
 
161 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  24.22 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0848  phage integrase family protein  22.16 
 
 
349 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0864  phage integrase family protein  22.16 
 
 
349 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0352184  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  35.33 
 
 
383 aa  81.3  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  25.12 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  28.12 
 
 
397 aa  79.3  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  21.12 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.79 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.79 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  20.59 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3269  phage integrase family protein  29.9 
 
 
465 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  29.37 
 
 
365 aa  77.8  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  27.88 
 
 
394 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  27.84 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  23.71 
 
 
392 aa  74.7  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_007777  Francci3_0407  phage integrase  27.66 
 
 
503 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>