249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0439 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0439  Hly-III family protein  100 
 
 
218 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7682  hemolysin III family channel protein  63.64 
 
 
224 aa  235  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2335  Hly-III family protein  55.61 
 
 
243 aa  229  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126816  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0735  Hly-III family protein  52.94 
 
 
221 aa  228  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  56.06 
 
 
366 aa  218  5e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  55.83 
 
 
268 aa  216  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08260  predicted membrane protein, hemolysin III  52.43 
 
 
262 aa  214  7e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1888  Hly-III family protein  51.44 
 
 
274 aa  207  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1055  Hly-III family protein  50.47 
 
 
254 aa  207  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2630  Hly-III family protein  49.52 
 
 
225 aa  194  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.468291  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  43.69 
 
 
305 aa  192  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23050  predicted membrane protein, hemolysin III  50 
 
 
276 aa  190  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1083  Hly-III family protein  47.83 
 
 
249 aa  190  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0832  hemolysin III family channel protein  43.48 
 
 
273 aa  188  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1104  Hly-III family protein  48.79 
 
 
246 aa  185  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2054  hemolysin III family channel protein  48.02 
 
 
250 aa  185  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4663  hemolysin III family channel protein  47.52 
 
 
243 aa  185  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1243  Hly-III family protein  49.51 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  46.23 
 
 
225 aa  178  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4138  hemolysin III family channel protein  44.34 
 
 
247 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4213  hemolysin III family channel protein  44.34 
 
 
247 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370881  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4369  hemolysin III family channel protein  44.34 
 
 
247 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221935  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0945  Hly-III family protein  48.53 
 
 
250 aa  174  7e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0093  hemolysin III family channel protein  44.34 
 
 
225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1172  Hly-III family protein  44.93 
 
 
243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0713  channel protein, hemolysin III family  41.15 
 
 
225 aa  166  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  41.31 
 
 
270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5041  hemolysin III family channel protein  45.24 
 
 
270 aa  161  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.45647  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0767  hemolysin III-like membrane protein  40.65 
 
 
314 aa  160  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00245971  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05120  channel protein, hemolysin III family  46.89 
 
 
239 aa  159  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.297417  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4658  hemolysin III family channel protein  45.24 
 
 
270 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.096872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4746  hemolysin III family channel protein  45.24 
 
 
270 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1532  channel protein, hemolysin III family  43.89 
 
 
218 aa  158  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104876  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11103  hemolysin-like protein  38.86 
 
 
242 aa  158  7e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2817e-49  normal  0.398095 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31590  channel protein, hemolysin III family  45.54 
 
 
229 aa  158  7e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1523  hemolysin III family channel protein  46.41 
 
 
200 aa  152  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4414  channel protein, hemolysin III family  42.38 
 
 
225 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1355  putative hemolysin III-like membrane protein  41.4 
 
 
285 aa  147  8e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.648452  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1200  hemolysin III family channel protein  45.54 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1656  channel protein, hemolysin III family  43.19 
 
 
224 aa  143  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3062  hemolysin III family channel protein  43.96 
 
 
216 aa  138  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1283  channel protein, hemolysin III family  41.12 
 
 
219 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5336  channel protein, hemolysin III family  40.1 
 
 
235 aa  131  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  40 
 
 
218 aa  131  7.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  39.41 
 
 
217 aa  131  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_199  membrane protein, Hly III family  40.62 
 
 
195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1153  hemolysin III family channel protein  40.19 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1213  channel protein, hemolysin III family  41.4 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0223  hemolysin, putative  40.1 
 
 
195 aa  129  3e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  39.58 
 
 
192 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  36.84 
 
 
232 aa  123  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  38.97 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  40.91 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  35.32 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  34.31 
 
 
214 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  31.61 
 
 
215 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  31.09 
 
 
215 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  31.09 
 
 
215 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  31.09 
 
 
215 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  37.56 
 
 
216 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  36.1 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  32.77 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  34.32 
 
 
215 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  34.32 
 
 
215 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  32.14 
 
 
215 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  32.14 
 
 
215 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  32.83 
 
 
215 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  32.14 
 
 
215 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  32.14 
 
 
215 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  36.95 
 
 
214 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0246  channel protein, hemolysin III family  33.33 
 
 
230 aa  104  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  34.8 
 
 
218 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3595  hemolysin III family channel protein  34.01 
 
 
216 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2171  hemolysin III  29.73 
 
 
213 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.255778  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  34.39 
 
 
223 aa  102  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1882  hemolysin III  29.47 
 
 
216 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  32.29 
 
 
215 aa  100  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  34.87 
 
 
259 aa  99.8  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  36.76 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04990  predicted membrane protein, hemolysin III  35.21 
 
 
228 aa  99.4  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.900042  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  32.29 
 
 
257 aa  98.6  7e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2864  Hly-III family protein  33.66 
 
 
239 aa  97.8  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.107423  normal  0.018726 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  32 
 
 
224 aa  96.7  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002051  hypothetical protein  31.31 
 
 
217 aa  95.9  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  29.7 
 
 
208 aa  95.5  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  33.17 
 
 
215 aa  95.1  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  32.67 
 
 
215 aa  94  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  28.44 
 
 
233 aa  93.6  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2479  putative hemolysin  34.52 
 
 
215 aa  94  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2385  hemolysin III family channel protein  33.93 
 
 
249 aa  93.2  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.872491  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  30.5 
 
 
218 aa  92.8  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1889  Hly-III family protein  35.68 
 
 
226 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  0.582334 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1608  Hly-III family protein  35.68 
 
 
226 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.60621  normal  0.167379 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  29.5 
 
 
219 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  29.5 
 
 
219 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  29.5 
 
 
219 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  29.5 
 
 
219 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  29.5 
 
 
219 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  29.5 
 
 
219 aa  91.7  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  29.5 
 
 
219 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>