17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0401 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0401  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  431  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3204  hypothetical protein  57.92 
 
 
220 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20809  unclonable  0.0000000000140296 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0045  hypothetical protein  34.31 
 
 
218 aa  84.7  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0121  hypothetical protein  32.74 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0298502  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0084  hypothetical protein  33.16 
 
 
217 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5845  hypothetical protein  30.59 
 
 
215 aa  58.9  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12250  hypothetical protein  32.74 
 
 
228 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0784  hypothetical protein  26.51 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67545  predicted protein  30 
 
 
348 aa  56.2  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.301787 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05705  Golgi phosphoprotein 3 (GPP34) domain containing protein (AFU_orthologue; AFUA_1G06630)  32.12 
 
 
353 aa  55.8  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02330  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  28.12 
 
 
386 aa  50.1  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14460  hypothetical protein  28.7 
 
 
226 aa  49.7  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4823  hypothetical protein  26.49 
 
 
242 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000842276  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0267  hypothetical protein  30.06 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.202879  normal  0.132358 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1965  hypothetical protein  30.54 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0430  hypothetical protein  29.63 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.119408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5198  hypothetical protein  34.52 
 
 
275 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0646774  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>