44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0391 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0391  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 
446 aa  915    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5245  peptidase M14 carboxypeptidase A  59.58 
 
 
432 aa  531  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.510355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1643  peptidase M14 carboxypeptidase A  56.15 
 
 
440 aa  508  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1183  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.58 
 
 
1061 aa  233  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.43 
 
 
773 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21250  predicted carboxypeptidase  30.12 
 
 
403 aa  145  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39208  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2367  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.03 
 
 
428 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127032  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.34 
 
 
1034 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1701  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.59 
 
 
1034 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6479  hypothetical protein  28.4 
 
 
606 aa  123  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4082  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.27 
 
 
626 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221076  normal  0.0678076 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3105  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.2 
 
 
632 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000214938  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4502  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.86 
 
 
628 aa  120  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5723  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.21 
 
 
439 aa  120  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2507  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.63 
 
 
378 aa  113  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4758  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.54 
 
 
824 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117112  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2489  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.81 
 
 
1074 aa  104  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06119  zinc carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08790)  28.05 
 
 
586 aa  77  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5783  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.24 
 
 
457 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0804955  normal  0.645968 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.83 
 
 
889 aa  70.9  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  28.27 
 
 
821 aa  70.5  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2914  carboxypeptidase A  27.24 
 
 
429 aa  70.1  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000427177 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1934  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.5 
 
 
563 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0111552  hitchhiker  0.00000196465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.05 
 
 
557 aa  67.8  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3806  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.27 
 
 
356 aa  67  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0393058  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8143  hypothetical protein  27.55 
 
 
815 aa  67  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.797388 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0658  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.23 
 
 
379 aa  66.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.481628  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4108  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.63 
 
 
557 aa  63.9  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3057  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.3 
 
 
568 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32238  predicted protein  20.94 
 
 
502 aa  60.1  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.237691  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3064  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.01 
 
 
558 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.211904  normal  0.375017 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.71 
 
 
406 aa  54.3  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000158618  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02640  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  28.5 
 
 
507 aa  52.8  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42459  predicted protein  24.15 
 
 
356 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0756  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.16 
 
 
414 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0770  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.16 
 
 
414 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0750  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.16 
 
 
414 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.992935 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  25.09 
 
 
423 aa  50.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3595  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.07 
 
 
553 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0167852 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.12 
 
 
384 aa  47  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1581  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.81 
 
 
559 aa  45.8  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1583  hypothetical protein  32.29 
 
 
452 aa  46.2  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0370379 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0196  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.55 
 
 
386 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.11 
 
 
262 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>