More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0277 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
208 aa  405  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.77 
 
 
209 aa  191  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.96 
 
 
211 aa  164  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  44.06 
 
 
206 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  45.23 
 
 
206 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  37.13 
 
 
208 aa  149  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.19 
 
 
208 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  40.67 
 
 
211 aa  142  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  35.75 
 
 
217 aa  141  7e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  37.2 
 
 
217 aa  141  8e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  38.61 
 
 
208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  39.81 
 
 
210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  39.81 
 
 
210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.11 
 
 
208 aa  139  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.62 
 
 
219 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  40.29 
 
 
210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  40.8 
 
 
204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  39.32 
 
 
210 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  40.8 
 
 
204 aa  138  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  40.8 
 
 
204 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  39.32 
 
 
210 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.06 
 
 
216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.31 
 
 
211 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.13 
 
 
208 aa  135  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  37.75 
 
 
203 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  40.49 
 
 
204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  38.5 
 
 
216 aa  134  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  37.37 
 
 
211 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  37.37 
 
 
211 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  37.37 
 
 
211 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  37.37 
 
 
211 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  37.37 
 
 
211 aa  134  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.31 
 
 
211 aa  134  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  37.37 
 
 
211 aa  134  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  38.83 
 
 
210 aa  134  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.58 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.95 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 
227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.95 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 
204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  39.51 
 
 
204 aa  132  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  37 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  37.8 
 
 
210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0885  lysine exporter protein LysE/YggA  41.12 
 
 
218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347055  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  37.38 
 
 
212 aa  131  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  37.81 
 
 
207 aa  131  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.76 
 
 
211 aa  130  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  38.89 
 
 
213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  36.87 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  37.88 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  39.7 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  39.51 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  34.78 
 
 
217 aa  129  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5446  lysine exporter protein LysE/YggA  39.52 
 
 
214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  34.98 
 
 
205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.24 
 
 
207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  39.5 
 
 
213 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 
214 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  38.59 
 
 
206 aa  128  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  37.75 
 
 
211 aa  128  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  37.93 
 
 
210 aa  128  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0612  RhtB family transporter  35.15 
 
 
209 aa  128  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  38.31 
 
 
207 aa  128  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  39.49 
 
 
207 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  37.31 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.9 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3539  lysine exporter protein LysE/YggA  41.15 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.439098 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  38.31 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  38.31 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  35.12 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  34.95 
 
 
211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.86 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.95 
 
 
208 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.81 
 
 
216 aa  126  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 
208 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.29 
 
 
209 aa  125  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  37.19 
 
 
210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.62 
 
 
209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  34.8 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0043  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 
210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.173523 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  38.31 
 
 
204 aa  124  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.17 
 
 
208 aa  124  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1168  leucine export protein LeuE  35.92 
 
 
223 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.950564  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  37.81 
 
 
204 aa  124  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  35.47 
 
 
212 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0322  lysine exporter protein LysE/YggA  39.8 
 
 
209 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279488  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 
210 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  35.5 
 
 
211 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.49 
 
 
204 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
214 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  38.89 
 
 
207 aa  124  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  35.71 
 
 
209 aa  123  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  38 
 
 
211 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0810  leucine export protein LeuE  36.14 
 
 
219 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  34.8 
 
 
213 aa  123  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  40.59 
 
 
206 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1291  leucine export protein LeuE  36.14 
 
 
219 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3652  amino acid transporter LysE  35.24 
 
 
210 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.41 
 
 
211 aa  122  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.889262  normal  0.234827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>