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for query gene Snas_0257 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
188 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  42.39 
 
 
205 aa  139  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  42.08 
 
 
299 aa  107  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  36.98 
 
 
188 aa  104  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  41.34 
 
 
184 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 
197 aa  96.3  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 
213 aa  96.3  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 
220 aa  95.9  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 
189 aa  95.5  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 
213 aa  95.5  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 
185 aa  93.6  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 
217 aa  93.6  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
196 aa  91.7  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
217 aa  90.9  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 
209 aa  90.5  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 
219 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 
189 aa  89.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
194 aa  89.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 
188 aa  88.6  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  33.51 
 
 
197 aa  88.2  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 
222 aa  88.2  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
192 aa  88.2  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
195 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
266 aa  87  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 
219 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 
199 aa  86.7  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 
228 aa  86.7  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  35.71 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  52.13 
 
 
194 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
232 aa  85.9  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
201 aa  86.3  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 
203 aa  85.1  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
193 aa  84.7  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 
199 aa  84.3  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  50.52 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  50.52 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 
259 aa  84  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 
223 aa  82  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
236 aa  81.3  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  31.38 
 
 
218 aa  81.3  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 
176 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 
198 aa  79.3  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 
195 aa  78.6  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5370  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 
196 aa  78.2  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  32.26 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  30.73 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 
229 aa  75.9  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1559  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1574  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  36.31 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  53.62 
 
 
195 aa  75.1  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
211 aa  74.3  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 
186 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  32.32 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  30.29 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
198 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  26.56 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  38.94 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4504  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1492  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
200 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
184 aa  72  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 
229 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 
186 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 
184 aa  71.2  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  34.24 
 
 
199 aa  71.2  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013510  Tcur_0767  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.504408  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal 
 
 
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NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
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