63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0187 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0187  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 153 aa  302  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.713112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2732  hypothetical protein  68.42 
 
 		 157 aa  202  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7675  transcriptional regulator, MarR family  61.97 
 
 		 157 aa  168  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12043  hypothetical protein  40.2 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.506773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1560  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2156  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  32.32 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0247  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0218  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.812852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  45.76 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 159 aa  51.2  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 180 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  25.64 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  27.94 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 174 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0862  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.529832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1105  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  28.99 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  41.51 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  26.32 
 
 		 283 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  36.27 
 
 		 318 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1721  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761179 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  31.15 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3646  transcriptional regulator, MarR family  27.86 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 202 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  40.74 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1446  regulatory protein MarR  43.75 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363143 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 154 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 		 164 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 189 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  20.31 
 
 		 165 aa  40.8  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  28.57 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 148 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  20.86 
 
 		 167 aa  40.4  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3956  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 148 aa  40.4  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>