236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0096 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 186 aa  363  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  73.89 
 
 		 186 aa  252  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  68.16 
 
 		 193 aa  237  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  56.11 
 
 		 189 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  48.31 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  46.41 
 
 		 184 aa  134  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  40.64 
 
 		 188 aa  110  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 166 aa  88.6  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4528  transcriptional regulator, TetR family  44.55 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 181 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  34.71 
 
 		 189 aa  72  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.81 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  25.81 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4477  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47529  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 182 aa  57  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 429 aa  56.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2126  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 204 aa  54.3  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 225 aa  53.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  24.57 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  34.93 
 
 		 221 aa  52.4  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 202 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 414 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 221 aa  51.6  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 248 aa  51.6  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 240 aa  51.6  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 197 aa  51.2  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 225 aa  51.2  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 225 aa  51.2  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 234 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2892  regulatory protein, TetR  35.96 
 
 		 635 aa  50.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794047  normal  0.565465 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  33.73 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 238 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 234 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07310  hypothetical protein  33.68 
 
 		 247 aa  49.3  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608576  normal  0.0646934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 209 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 234 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 189 aa  48.9  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 234 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  44.44 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  44.07 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  30.19 
 
 		 197 aa  48.9  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 240 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 308 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  35.66 
 
 		 208 aa  48.5  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 241 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 227 aa  48.5  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  29.19 
 
 		 203 aa  48.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 217 aa  48.1  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 208 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 218 aa  48.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 189 aa  47.8  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  37.18 
 
 		 215 aa  47.8  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  47.8  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 198 aa  47  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  46.77 
 
 		 237 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>