21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0077 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0077  hypothetical protein  100 
 
 		 585 aa  1150    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13790  hypothetical protein  52.51 
 
 		 599 aa  520  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24487  normal  0.123845 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1491  hypothetical protein  41.99 
 
 		 635 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241788  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1456  hypothetical protein  42.15 
 
 		 632 aa  396  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0137053  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4537  hypothetical protein  43.19 
 
 		 606 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6359  hypothetical protein  39.97 
 
 		 604 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.717517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1495  hypothetical protein  42.17 
 
 		 632 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276289  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1457  hypothetical protein  43.22 
 
 		 611 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4116  hypothetical protein  42.3 
 
 		 606 aa  350  6e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3325  hypothetical protein  39.75 
 
 		 607 aa  334  3e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3559  hypothetical protein  39.08 
 
 		 607 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0477684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8751  hypothetical protein  35.8 
 
 		 686 aa  279  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129004 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0362  hypothetical protein  30.33 
 
 		 679 aa  155  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6445  hypothetical protein  32.34 
 
 		 627 aa  153  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131326  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0443  hypothetical protein  27.35 
 
 		 617 aa  89.4  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128682  normal  0.673018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1838  hypothetical protein  29.41 
 
 		 712 aa  54.3  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.469371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2506  hypothetical protein  29.41 
 
 		 708 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0457  hypothetical protein  25.29 
 
 		 223 aa  52.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.471421  hitchhiker  0.00382778 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1472  hypothetical protein  23.42 
 
 		 723 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.954552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0850  hypothetical protein  24.51 
 
 		 721 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4066  hypothetical protein  27.02 
 
 		 715 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174208 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>