More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0065 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 934 aa  1854    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  39.7 
 
 		 935 aa  531  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  34.32 
 
 		 981 aa  450  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  35.68 
 
 		 1022 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  36.18 
 
 		 1013 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  34.81 
 
 		 992 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  39.35 
 
 		 990 aa  392  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  34.5 
 
 		 962 aa  389  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  33.3 
 
 		 1030 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  34.42 
 
 		 1088 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  32.85 
 
 		 996 aa  369  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  33.83 
 
 		 931 aa  369  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  33.62 
 
 		 1010 aa  366  1e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 1071 aa  365  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  37.22 
 
 		 1108 aa  364  4e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  31.83 
 
 		 1025 aa  363  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  35.42 
 
 		 910 aa  359  1.9999999999999998e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  34.26 
 
 		 950 aa  355  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  32.01 
 
 		 941 aa  355  2e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  34.35 
 
 		 926 aa  350  7e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 654 aa  342  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  31.93 
 
 		 1022 aa  340  5.9999999999999996e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  33.08 
 
 		 1020 aa  337  5.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  40.27 
 
 		 1003 aa  337  7e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  32.3 
 
 		 940 aa  335  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  39.1 
 
 		 910 aa  335  3e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  34.88 
 
 		 915 aa  332  2e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  31.39 
 
 		 1027 aa  332  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  31.54 
 
 		 913 aa  330  7e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  33.07 
 
 		 930 aa  330  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  31.78 
 
 		 1003 aa  329  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  37.95 
 
 		 1138 aa  329  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  32.76 
 
 		 964 aa  328  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  33.71 
 
 		 995 aa  327  5e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  39.38 
 
 		 1014 aa  327  5e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 1319 aa  327  6e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  32.27 
 
 		 990 aa  325  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  39.37 
 
 		 963 aa  325  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  32.07 
 
 		 956 aa  323  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.32 
 
 		 921 aa  322  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  32.67 
 
 		 954 aa  321  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 919 aa  321  5e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  37.14 
 
 		 992 aa  317  6e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  34.24 
 
 		 981 aa  316  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  37.72 
 
 		 1025 aa  316  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 1048 aa  314  4.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  32.63 
 
 		 928 aa  311  5e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  31.46 
 
 		 967 aa  309  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  31.39 
 
 		 971 aa  309  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  35.41 
 
 		 621 aa  307  5.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  31.38 
 
 		 1033 aa  306  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  30.63 
 
 		 946 aa  304  5.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 1346 aa  304  6.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  31.77 
 
 		 1008 aa  300  7e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  30.64 
 
 		 1021 aa  298  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  37.38 
 
 		 983 aa  298  5e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  30 
 
 		 1017 aa  293  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  32 
 
 		 928 aa  291  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  35.52 
 
 		 989 aa  290  8e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  33.88 
 
 		 1024 aa  290  8e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  31.37 
 
 		 921 aa  287  5e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  40.3 
 
 		 1001 aa  285  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  36.56 
 
 		 612 aa  276  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  37.42 
 
 		 775 aa  274  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  30.24 
 
 		 907 aa  273  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  29.06 
 
 		 965 aa  269  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  30.23 
 
 		 970 aa  268  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  32.67 
 
 		 965 aa  267  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  34.7 
 
 		 850 aa  267  8e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  36.9 
 
 		 632 aa  264  6.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  30 
 
 		 937 aa  256  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  28.79 
 
 		 1034 aa  256  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  29.93 
 
 		 1003 aa  254  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  33.76 
 
 		 908 aa  254  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  32.85 
 
 		 1030 aa  254  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 622 aa  253  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  30.12 
 
 		 993 aa  251  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  31.35 
 
 		 783 aa  245  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  33.39 
 
 		 788 aa  241  6.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.95 
 
 		 496 aa  238  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  33.44 
 
 		 1054 aa  236  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  32.34 
 
 		 631 aa  233  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  33.13 
 
 		 792 aa  232  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  37.3 
 
 		 994 aa  232  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  39.49 
 
 		 453 aa  231  6e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  30 
 
 		 982 aa  230  8e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  31.14 
 
 		 993 aa  229  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  33.66 
 
 		 775 aa  228  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  34.03 
 
 		 666 aa  226  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  30.23 
 
 		 790 aa  224  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  35.06 
 
 		 582 aa  224  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 621 aa  223  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 		 806 aa  221  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  31.89 
 
 		 797 aa  221  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  34.36 
 
 		 915 aa  217  8e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  30.04 
 
 		 757 aa  209  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  31.75 
 
 		 1004 aa  208  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  32.8 
 
 		 957 aa  206  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  31.55 
 
 		 715 aa  202  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5286  transcriptional regulator, XRE family  36.06 
 
 		 810 aa  201  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>