19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0056 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0056  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  357  4e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6046  hypothetical protein  51.7 
 
 		 270 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0936816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3341  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  51.35 
 
 		 238 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3113  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  49.32 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5617  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  48.34 
 
 		 256 aa  125  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  normal  0.170718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5484  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  42.77 
 
 		 239 aa  109  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000353718  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20680  hypothetical protein  44.2 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0485442  normal  0.374209 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2523  hypothetical protein  37.5 
 
 		 242 aa  94.4  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152944  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2050  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  41.94 
 
 		 272 aa  90.5  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.909792  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3655  hypothetical protein  43.61 
 
 		 230 aa  86.3  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0168589  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0282  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  39.22 
 
 		 281 aa  85.1  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278358 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2994  hypothetical protein  39.5 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0023036  hitchhiker  0.000591455 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0282  hypothetical protein  39.83 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0024  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  33.57 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1505  hypothetical protein  28.21 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1455  hypothetical protein  33.77 
 
 		 219 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0168  hypothetical protein  30.12 
 
 		 256 aa  52  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1506  hypothetical protein  27.91 
 
 		 253 aa  51.6  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000182579 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4508  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  32.12 
 
 		 284 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>