More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0031 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0031  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 307 aa  622  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0715  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  47.42 
 
 		 322 aa  194  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.598053  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1101  DNA protecting protein DprA  43.16 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00287455  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  32.97 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  39.81 
 
 		 370 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  42.04 
 
 		 394 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5585  SMF family protein  40.64 
 
 		 314 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  36.87 
 
 		 409 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  41.67 
 
 		 375 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  38.67 
 
 		 364 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00299  SMF protein  36.64 
 
 		 295 aa  145  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0738024  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  37.14 
 
 		 363 aa  144  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  38.84 
 
 		 358 aa  143  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  40.18 
 
 		 369 aa  143  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  39.16 
 
 		 356 aa  142  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2419  DNA protecting protein DprA  34.89 
 
 		 426 aa  140  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  41.31 
 
 		 362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  43.35 
 
 		 368 aa  139  7.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2199  SMF protein  40.48 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000000109566  n/a   
 
 
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  36.58 
 
 		 386 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1994  DNA protecting protein DprA  34.65 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1207  DNA processing protein DprA, putative  40.54 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.172047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  35.71 
 
 		 371 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  37.87 
 
 		 418 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  36.87 
 
 		 364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  36.68 
 
 		 406 aa  136  4e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0829  SMF protein  37.86 
 
 		 302 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000000494778  unclonable  0.00000053087 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  39.13 
 
 		 369 aa  136  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  42.86 
 
 		 370 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  42.39 
 
 		 375 aa  135  6.0000000000000005e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  35.63 
 
 		 385 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1020  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  40.24 
 
 		 295 aa  135  8e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.274867  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3657  DNA protecting protein DprA  34.36 
 
 		 289 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00245639  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  33.96 
 
 		 359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0922  DNA processing protein, Smf family  41.18 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 337 aa  133  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  33.19 
 
 		 365 aa  133  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  33.47 
 
 		 364 aa  133  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  40.45 
 
 		 380 aa  133  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  36.41 
 
 		 365 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  40.11 
 
 		 360 aa  133  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  37.22 
 
 		 356 aa  132  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  36.27 
 
 		 368 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3593  SMF family nucleotide-binding protein  33.61 
 
 		 289 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.46698  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  33.78 
 
 		 352 aa  132  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1006  DprA/SMF protein, putative DNA processing factor  40.23 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048542  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1041  DNA protecting protein DprA  39.45 
 
 		 338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367593  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  35.36 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  33.94 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  35.78 
 
 		 330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  36.27 
 
 		 748 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  36.05 
 
 		 361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  32.41 
 
 		 362 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  34.33 
 
 		 359 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  38.95 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  35.12 
 
 		 331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3932  DNA processing Smf protein  32.55 
 
 		 289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000528379  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0895  SMF family protein  36.24 
 
 		 277 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0725141  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  36.15 
 
 		 373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1447  SMF protein  39.9 
 
 		 385 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  36.57 
 
 		 349 aa  129  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  43.02 
 
 		 366 aa  129  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  41.53 
 
 		 338 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2486  DNA protecting protein DprA  35.38 
 
 		 291 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000522014  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1548  DNA protecting protein DprA  39.19 
 
 		 391 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.20886 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  40.91 
 
 		 365 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1311  DNA processing Smf protein  31.76 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3876  Smf family DNA processing protein  32.78 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000864886  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  35.58 
 
 		 360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  41.18 
 
 		 385 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3846  DNA processing Smf protein  32.78 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3881  DNA processing Smf protein  32.37 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000554633  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  39.88 
 
 		 338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  41.04 
 
 		 368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  38.73 
 
 		 338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  34.75 
 
 		 362 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  38.73 
 
 		 338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3575  SMF family nucleotide-binding protein  32.78 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00451445  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  30.97 
 
 		 361 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  39.88 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  39.88 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  39.31 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  36.59 
 
 		 373 aa  127  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  35.58 
 
 		 360 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  38.73 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  32.68 
 
 		 369 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  35.09 
 
 		 372 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  39.53 
 
 		 340 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  37.77 
 
 		 362 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  32.13 
 
 		 382 aa  126  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  38.73 
 
 		 338 aa  125  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3673  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 366 aa  125  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917953  normal  0.236598 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  30.97 
 
 		 361 aa  125  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  41.01 
 
 		 360 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  38.76 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2865  DNA processing protein DprA, putative  33.33 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  39.89 
 
 		 442 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  39.47 
 
 		 371 aa  123  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0915  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  36.78 
 
 		 281 aa  123  4e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>