20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0029 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0029  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  616  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7410  hypothetical protein  36.84 
 
 
375 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8946  hypothetical protein  29.06 
 
 
351 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00178879  normal  0.674352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8929  hypothetical protein  28.12 
 
 
393 aa  85.9  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0590592  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0964  hypothetical protein  27.61 
 
 
443 aa  79.7  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111427  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2102  hypothetical protein  29.34 
 
 
485 aa  79  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1992  hypothetical protein  31.51 
 
 
641 aa  66.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6872  hypothetical protein  27.54 
 
 
362 aa  55.8  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4626  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  30.36 
 
 
602 aa  53.1  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8605  pentapeptide repeat protein  38.89 
 
 
354 aa  52.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101304  normal  0.331567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0442  hypothetical protein  25.11 
 
 
397 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2150  hypothetical protein  29.63 
 
 
313 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2836  pentapeptide repeat protein  19.33 
 
 
368 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  25.6 
 
 
489 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2291  hypothetical protein  25.1 
 
 
365 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0775084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3591  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  22.09 
 
 
945 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1073  hypothetical protein  31.03 
 
 
464 aa  43.5  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1861  hypothetical protein  40 
 
 
229 aa  43.5  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.582955 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  24.59 
 
 
493 aa  42.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5019  pentapeptide repeat-containing protein  37.29 
 
 
298 aa  42.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>