More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0027 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  66.21 
 
 
639 aa  726  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
582 aa  1160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  66.38 
 
 
603 aa  727  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  56.51 
 
 
579 aa  615  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6538e-07 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  57.47 
 
 
568 aa  613  1e-174  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  57.22 
 
 
569 aa  611  1e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  55.17 
 
 
583 aa  606  1e-172  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  55.85 
 
 
577 aa  603  1e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  59.06 
 
 
552 aa  600  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  56.99 
 
 
574 aa  596  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  56.81 
 
 
605 aa  593  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  56.59 
 
 
600 aa  595  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  56.16 
 
 
578 aa  592  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  55.34 
 
 
572 aa  587  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  58.82 
 
 
595 aa  586  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  56.83 
 
 
593 aa  578  1e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  57.06 
 
 
574 aa  577  1e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  55.68 
 
 
567 aa  573  1e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  54.3 
 
 
579 aa  567  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  54.58 
 
 
554 aa  559  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  52.71 
 
 
579 aa  555  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  53.26 
 
 
584 aa  556  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  53.79 
 
 
587 aa  554  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  53.65 
 
 
573 aa  548  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  53.24 
 
 
573 aa  542  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  55.06 
 
 
575 aa  542  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  51.14 
 
 
582 aa  532  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.18 
 
 
585 aa  534  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  51.72 
 
 
603 aa  525  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  54.03 
 
 
576 aa  519  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  50.35 
 
 
585 aa  518  1e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  51.99 
 
 
579 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  51.99 
 
 
579 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  51.99 
 
 
579 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  50.09 
 
 
582 aa  509  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  52.38 
 
 
581 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  51.8 
 
 
585 aa  495  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  51.22 
 
 
582 aa  495  1e-138  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  46.92 
 
 
582 aa  484  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  46.79 
 
 
591 aa  464  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  48.37 
 
 
567 aa  461  1e-128  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.37 
 
 
583 aa  454  1e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  49.14 
 
 
583 aa  388  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  44.18 
 
 
562 aa  388  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  42.44 
 
 
581 aa  378  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 
546 aa  327  3e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  39.45 
 
 
531 aa  317  5e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  40.48 
 
 
532 aa  317  5e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  36.4 
 
 
543 aa  309  1e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  39.52 
 
 
545 aa  308  2e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  38.52 
 
 
516 aa  303  4e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  38.09 
 
 
539 aa  301  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  39.11 
 
 
543 aa  300  5e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 
542 aa  299  8e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.13 
 
 
530 aa  296  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  1.66291e-05 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  35.57 
 
 
552 aa  296  7e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  38.17 
 
 
537 aa  295  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  40.04 
 
 
524 aa  290  6e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  39.22 
 
 
534 aa  288  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  38.65 
 
 
519 aa  288  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  35.22 
 
 
525 aa  287  4e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.71 
 
 
525 aa  287  4e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  39.11 
 
 
557 aa  284  4e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  37.06 
 
 
537 aa  283  8e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  37.52 
 
 
559 aa  282  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  37.28 
 
 
559 aa  281  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  37.52 
 
 
518 aa  279  9e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  37.8 
 
 
546 aa  278  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  37.96 
 
 
529 aa  278  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  34.6 
 
 
566 aa  277  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33290  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  41.89 
 
 
522 aa  275  1e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.954815  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  37.62 
 
 
519 aa  275  2e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  38.03 
 
 
560 aa  274  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917369 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  34.17 
 
 
700 aa  273  6e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  37.57 
 
 
532 aa  271  3e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  38.39 
 
 
567 aa  271  3e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  37.35 
 
 
532 aa  270  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  8.68135e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  37.15 
 
 
547 aa  269  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  38.2 
 
 
548 aa  269  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  38.63 
 
 
559 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  38.92 
 
 
559 aa  266  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  34.89 
 
 
576 aa  261  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  37.45 
 
 
536 aa  259  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  36.96 
 
 
533 aa  259  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  8.58537e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  34.34 
 
 
519 aa  257  4e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6684  FAD dependent oxidoreductase  41.23 
 
 
516 aa  256  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.414435  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2239  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  40.7 
 
 
502 aa  255  2e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.126564 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  35.45 
 
 
543 aa  252  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  37.31 
 
 
528 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  1.74141e-05  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3651  FAD dependent oxidoreductase  37.48 
 
 
522 aa  250  5e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1796  FAD dependent oxidoreductase  40.55 
 
 
518 aa  250  6e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00246275  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5601  FAD dependent oxidoreductase  39.05 
 
 
538 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0340972  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  37.5 
 
 
517 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  34.93 
 
 
556 aa  246  8e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2576  FAD dependent oxidoreductase  38.79 
 
 
508 aa  246  1e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  36.25 
 
 
602 aa  244  4e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2773  FAD dependent oxidoreductase  39.71 
 
 
507 aa  243  9e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114338  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1956  FAD dependent oxidoreductase  40.12 
 
 
520 aa  241  3e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  34.15 
 
 
557 aa  239  8e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  34.96 
 
 
545 aa  239  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>