255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0022 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0022  TrkA-N domain-containing protein  100 
 
 		 553 aa  1101    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.377987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0242  TrkA domain-containing protein  41.45 
 
 		 668 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0283  TrkA domain-containing protein  39.25 
 
 		 639 aa  306  6e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244298  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2117  TrkA-N domain protein  35.61 
 
 		 569 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4032  TrkA-N  28.74 
 
 		 565 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.341469 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2853  TrkA-N  27.87 
 
 		 561 aa  123  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3306  TrkA-N domain protein  28.77 
 
 		 568 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.484589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2794  TrkA-N domain protein  29 
 
 		 568 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2939  TrkA-N  27.84 
 
 		 749 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3336  TrkA domain-containing protein  29.82 
 
 		 359 aa  99.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.819763  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3105  TrkA-N  21.79 
 
 		 683 aa  95.1  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.716552 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4290  TrkA domain-containing protein  35.37 
 
 		 606 aa  94.4  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286091  decreased coverage  0.00534263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0931  TrkA domain-containing protein  30.68 
 
 		 605 aa  93.6  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18233  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4226  TrkA-N domain protein  22.82 
 
 		 682 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2769  TrkA-N domain protein  38.64 
 
 		 565 aa  91.3  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4414  TrkA-N domain protein  24.5 
 
 		 676 aa  84  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4477  TrkA-N domain protein  23.93 
 
 		 676 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124156 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0210  TrkA-N domain protein  34.15 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  25.77 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  28.12 
 
 		 668 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  27.83 
 
 		 337 aa  69.7  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  23.49 
 
 		 324 aa  70.1  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0633  TrkA-N domain protein  32.23 
 
 		 248 aa  69.3  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  26.87 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  25.96 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  25 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  40.59 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  24.12 
 
 		 351 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  24.55 
 
 		 355 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  26.77 
 
 		 332 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  24.12 
 
 		 351 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  24.12 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  27.57 
 
 		 658 aa  64.7  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  26.18 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  26.95 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  24.05 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  35.71 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  26.57 
 
 		 672 aa  61.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  27.7 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  22.36 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  25.57 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  24.89 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  25.34 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  24.66 
 
 		 351 aa  59.7  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  23.46 
 
 		 330 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  35.45 
 
 		 359 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  23 
 
 		 330 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  23.67 
 
 		 330 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  27.24 
 
 		 332 aa  59.3  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  24.89 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  24.24 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  30.66 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  26.38 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  32.14 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  26.72 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.18 
 
 		 697 aa  58.2  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0402  sodium/hydrogen exchanger  29.91 
 
 		 562 aa  58.2  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  29.15 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  23.89 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  32.65 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  32.46 
 
 		 561 aa  57.8  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  26.83 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  32.46 
 
 		 561 aa  57.4  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  27.91 
 
 		 337 aa  57  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  25.71 
 
 		 662 aa  56.2  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  26.29 
 
 		 221 aa  56.2  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  27.78 
 
 		 347 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1132  hypothetical protein  33.63 
 
 		 564 aa  55.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  24.51 
 
 		 368 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  31.25 
 
 		 346 aa  56.2  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1602  TrkA-N domain protein  27.05 
 
 		 228 aa  55.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.316093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  25.99 
 
 		 221 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  21.25 
 
 		 335 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  26.29 
 
 		 221 aa  55.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  26.7 
 
 		 220 aa  55.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  22.22 
 
 		 341 aa  55.1  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  27.06 
 
 		 350 aa  55.1  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3033  putative cation:proton antiport protein  33.04 
 
 		 561 aa  55.1  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  20.97 
 
 		 335 aa  54.7  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  25.29 
 
 		 357 aa  54.7  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  26.98 
 
 		 630 aa  53.9  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1276  TrkA-N domain protein  26.7 
 
 		 228 aa  53.9  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  22.55 
 
 		 337 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  23.46 
 
 		 362 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  26.77 
 
 		 364 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2875  TrkA-N domain protein  28.12 
 
 		 226 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2149  sodium/hydrogen exchanger  35.64 
 
 		 567 aa  53.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2358  TrkA domain-containing protein  25.1 
 
 		 564 aa  53.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  30.43 
 
 		 562 aa  52.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  24.86 
 
 		 335 aa  52.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  26.77 
 
 		 364 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  26.77 
 
 		 364 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  23.85 
 
 		 355 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  24.54 
 
 		 350 aa  52.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  25.96 
 
 		 218 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  26.63 
 
 		 350 aa  52  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  26.03 
 
 		 219 aa  51.6  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2258  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 		 236 aa  52  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  22.6 
 
 		 351 aa  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  26.63 
 
 		 350 aa  51.6  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>