More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1502 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 365 aa  718    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0097  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 190 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000012965  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 		 185 aa  171  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  44.44 
 
 		 191 aa  162  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  46.81 
 
 		 184 aa  159  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  41.18 
 
 		 190 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  41.18 
 
 		 190 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  46.58 
 
 		 186 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 		 185 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  42.02 
 
 		 189 aa  157  3e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  49.68 
 
 		 186 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  49.68 
 
 		 186 aa  156  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  49.68 
 
 		 186 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  47.5 
 
 		 186 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  49.03 
 
 		 207 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  49.03 
 
 		 207 aa  156  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  49.03 
 
 		 207 aa  156  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  49.03 
 
 		 210 aa  156  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  49.03 
 
 		 207 aa  155  8e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  49.03 
 
 		 186 aa  155  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  41.18 
 
 		 190 aa  155  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.5 
 
 		 191 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  37.85 
 
 		 239 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  48.17 
 
 		 189 aa  154  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  48.39 
 
 		 207 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  44.52 
 
 		 205 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  43.58 
 
 		 186 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  48.17 
 
 		 189 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  37.43 
 
 		 188 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.2 
 
 		 206 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  47.53 
 
 		 189 aa  151  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1616  peptidyl-tRNA hydrolase  43.22 
 
 		 202 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.08 
 
 		 210 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03281  peptidyl-tRNA hydrolase  43.22 
 
 		 202 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  42.71 
 
 		 188 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  36.73 
 
 		 191 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  42.71 
 
 		 188 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.02 
 
 		 213 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 196 aa  145  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  45.41 
 
 		 180 aa  145  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1364  peptidyl-tRNA hydrolase  43.62 
 
 		 179 aa  145  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  45.34 
 
 		 193 aa  145  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.853012  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0352  peptidyl-tRNA hydrolase  34.85 
 
 		 225 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320411  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0357  peptidyl-tRNA hydrolase  43.09 
 
 		 181 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.52807  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0947  peptidyl-tRNA hydrolase  36.41 
 
 		 235 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  35.64 
 
 		 206 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0334  peptidyl-tRNA hydrolase  43.09 
 
 		 181 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0105  peptidyl-tRNA hydrolase  43.32 
 
 		 186 aa  144  3e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  40.78 
 
 		 219 aa  144  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  40.53 
 
 		 188 aa  144  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.19 
 
 		 206 aa  142  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2483  peptidyl-tRNA hydrolase  38.51 
 
 		 225 aa  142  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.697792  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0824  peptidyl-tRNA hydrolase  38.51 
 
 		 225 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1073  peptidyl-tRNA hydrolase  34.55 
 
 		 199 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  35.86 
 
 		 196 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2393  peptidyl-tRNA hydrolase  39.75 
 
 		 203 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2264  peptidyl-tRNA hydrolase  36.87 
 
 		 248 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.38143 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  39.49 
 
 		 202 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  39.49 
 
 		 202 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  48.7 
 
 		 205 aa  139  6e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  41.94 
 
 		 191 aa  139  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  43.78 
 
 		 186 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0337  peptidyl-tRNA hydrolase  40.64 
 
 		 181 aa  139  8.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.17 
 
 		 183 aa  139  8.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1653  peptidyl-tRNA hydrolase  42.02 
 
 		 181 aa  139  8.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00866088  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  37.93 
 
 		 213 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2474  peptidyl-tRNA hydrolase  37.89 
 
 		 210 aa  138  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1264  peptidyl-tRNA hydrolase  39.13 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2697  peptidyl-tRNA hydrolase  37.89 
 
 		 210 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2818  peptidyl-tRNA hydrolase  39.13 
 
 		 203 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0122203  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4160  peptidyl-tRNA hydrolase  38.51 
 
 		 207 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.199794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2402  peptidyl-tRNA hydrolase  37.27 
 
 		 210 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4000  peptidyl-tRNA hydrolase  36.97 
 
 		 207 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  35.29 
 
 		 201 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  37.89 
 
 		 206 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  35.59 
 
 		 201 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4125  peptidyl-tRNA hydrolase  38.31 
 
 		 202 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  44.32 
 
 		 186 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0466  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 		 184 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.916816  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  45.45 
 
 		 189 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  44.44 
 
 		 193 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf853  peptidyl-tRNA hydrolase  43.09 
 
 		 181 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  37.89 
 
 		 198 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  34.01 
 
 		 211 aa  134  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  37.1 
 
 		 193 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2128  peptidyl-tRNA hydrolase  37.3 
 
 		 201 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328007  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  38.51 
 
 		 204 aa  134  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  34.01 
 
 		 211 aa  134  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  39.76 
 
 		 190 aa  134  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0489  peptidyl-tRNA hydrolase  36.96 
 
 		 202 aa  134  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00415538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  38.41 
 
 		 217 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2511  peptidyl-tRNA hydrolase  37.27 
 
 		 202 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7303  predicted protein  34.04 
 
 		 189 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00433512  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.58 
 
 		 195 aa  133  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1663  peptidyl-tRNA hydrolase  41.49 
 
 		 181 aa  133  6e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1768  peptidyl-tRNA hydrolase  37.58 
 
 		 201 aa  133  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2768  peptidyl-tRNA hydrolase  39.67 
 
 		 243 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.53 
 
 		 193 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  38.51 
 
 		 202 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  37.63 
 
 		 209 aa  132  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>