More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1490 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1490  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 225 aa  440  1e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  57.66 
 
 		 219 aa  246  2e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  53.81 
 
 		 223 aa  236  2e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  47.96 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  47.96 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 240 aa  225  4e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  48.42 
 
 		 224 aa  225  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  47.96 
 
 		 224 aa  224  6e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  47.51 
 
 		 224 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  47.51 
 
 		 224 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.34 
 
 		 224 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.89 
 
 		 224 aa  218  7.999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  46.88 
 
 		 224 aa  217  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.3 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 224 aa  209  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 283 aa  208  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  44.39 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 222 aa  200  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 224 aa  198  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0197  transcriptional activator protein, response regulator  43.81 
 
 		 227 aa  195  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0086442  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 223 aa  194  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0535  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.660155  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  41.7 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.7 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.7 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.7 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1433  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1997  winged helix family two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 224 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.981118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2126  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 		 224 aa  191  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245988  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1658  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 230 aa  191  7e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1187  two component transcriptional regulatory protein  41.78 
 
 		 223 aa  191  8e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3454  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 257 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3067  two component transcriptional regulator  41.82 
 
 		 224 aa  191  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0894  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 222 aa  190  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1841  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 		 216 aa  190  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0207334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 227 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2674  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238816  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3722  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0917  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 223 aa  188  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1751  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.44 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.6 
 
 		 223 aa  188  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 		 223 aa  188  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1407  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 225 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440596  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1685  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 225 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00118059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1411  response regulator receiver  41.07 
 
 		 225 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.63 
 
 		 225 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  39.73 
 
 		 226 aa  188  7e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5383  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.89 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.651671 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.33 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2960  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.18 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001641  putative two component response regulator transcription regulator protein  40.87 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.170142  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  43.12 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.72 
 
 		 224 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.82 
 
 		 224 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  42.22 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3412  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.7 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 221 aa  186  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  42.66 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.64 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2619  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3961  heavy metal response regulator  41.07 
 
 		 229 aa  185  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.59 
 
 		 225 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  41.26 
 
 		 228 aa  185  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 		 227 aa  185  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.59 
 
 		 225 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.59 
 
 		 225 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2007  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 223 aa  185  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  41.18 
 
 		 223 aa  185  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  40.81 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2840  two component transcriptional regulator  43.58 
 
 		 226 aa  185  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.22 
 
 		 225 aa  185  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.91 
 
 		 239 aa  184  7e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4535  two component transcriptional regulator  41.26 
 
 		 227 aa  184  7e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 		 225 aa  184  8e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0489  response regulator for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  40.91 
 
 		 224 aa  184  9e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  43.58 
 
 		 223 aa  184  9e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.67 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1461  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.48 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  41.26 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0422  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.44 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0603  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  39.82 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1497  heavy metal response regulator  42.15 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0428  transcriptional regulator FeuP  41.36 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.461578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  39.91 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.33 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>