198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1483 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  100 
 
 
1333 aa  2610    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  57.84 
 
 
1065 aa  721    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  57.26 
 
 
1230 aa  900    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  78.44 
 
 
998 aa  476  1e-132  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  58.3 
 
 
595 aa  278  6e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  67.72 
 
 
1212 aa  274  1e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  39.66 
 
 
1411 aa  272  2.9999999999999997e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1341  YadA domain protein  60.71 
 
 
563 aa  270  1e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  60.18 
 
 
691 aa  263  2e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1334  YadA domain protein  62.26 
 
 
565 aa  262  3e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  59.73 
 
 
600 aa  260  1e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  57.81 
 
 
572 aa  253  2e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  29 
 
 
2095 aa  218  8e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  66.45 
 
 
1813 aa  209  2e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0600  YadA domain protein  52.74 
 
 
601 aa  198  5.000000000000001e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  60.98 
 
 
1014 aa  193  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  30.46 
 
 
827 aa  170  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  30.67 
 
 
1616 aa  143  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  30.67 
 
 
1616 aa  142  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  30.67 
 
 
1616 aa  142  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  29.65 
 
 
617 aa  140  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  31.54 
 
 
1117 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  30.99 
 
 
1588 aa  137  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  28.53 
 
 
1186 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0209  large adhesin  27.89 
 
 
5143 aa  135  6.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  27.35 
 
 
1854 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  26.65 
 
 
1471 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  26.65 
 
 
1471 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  30.04 
 
 
2396 aa  133  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  26.79 
 
 
1613 aa  131  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  25.89 
 
 
1546 aa  131  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  27.34 
 
 
1265 aa  125  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  28.7 
 
 
1434 aa  124  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  32.94 
 
 
1674 aa  119  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  36.41 
 
 
1916 aa  117  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  45.19 
 
 
2091 aa  116  3e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  27.32 
 
 
650 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  25.47 
 
 
4526 aa  115  5e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  45.59 
 
 
2092 aa  115  5e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  46.32 
 
 
2075 aa  114  9e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  45.19 
 
 
2078 aa  114  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  45.19 
 
 
2073 aa  114  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  27.62 
 
 
1516 aa  113  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  25.74 
 
 
2157 aa  112  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  34.65 
 
 
655 aa  111  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  26.42 
 
 
2866 aa  111  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  29.69 
 
 
962 aa  111  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  27.22 
 
 
1122 aa  110  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  27.02 
 
 
3355 aa  110  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  27.96 
 
 
737 aa  110  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  27.19 
 
 
1090 aa  109  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  27.22 
 
 
1074 aa  110  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  27.19 
 
 
1090 aa  109  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  27.19 
 
 
1090 aa  109  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  26.32 
 
 
1122 aa  109  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  27.19 
 
 
1122 aa  110  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  32.99 
 
 
492 aa  109  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  26.46 
 
 
2814 aa  108  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  28.12 
 
 
2505 aa  108  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  28.02 
 
 
1012 aa  108  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  26.91 
 
 
1814 aa  106  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  25.8 
 
 
877 aa  105  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  28.85 
 
 
810 aa  105  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  28.31 
 
 
1353 aa  104  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  29.64 
 
 
1068 aa  103  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  26.46 
 
 
2728 aa  103  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  26.46 
 
 
2778 aa  103  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224013 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  27.79 
 
 
831 aa  102  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  27.79 
 
 
831 aa  102  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  34.73 
 
 
2078 aa  103  3e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  27.79 
 
 
816 aa  103  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  27.79 
 
 
816 aa  102  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  27.79 
 
 
820 aa  102  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  27.79 
 
 
816 aa  102  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  27.79 
 
 
816 aa  102  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  27.05 
 
 
2392 aa  101  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  28.95 
 
 
1487 aa  101  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1401  putative large adhesin  34.11 
 
 
1405 aa  100  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.018922  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  32.91 
 
 
1549 aa  99.8  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  28.28 
 
 
831 aa  96.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1154  large adhesin  32.07 
 
 
3554 aa  97.1  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0912  adhesin/hemagglutinin  25.44 
 
 
1259 aa  97.4  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.358303  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03061  adhesin-like protein B  25.91 
 
 
989 aa  95.9  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0589  adhesin  32.17 
 
 
386 aa  95.1  8e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1616  large adhesin  28.4 
 
 
3078 aa  94.4  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  26.89 
 
 
4726 aa  94  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  30.77 
 
 
1654 aa  93.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  28.29 
 
 
2868 aa  92.8  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  31.65 
 
 
2493 aa  92.8  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  29.74 
 
 
2906 aa  92.4  6e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  28.47 
 
 
3635 aa  90.1  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0602  adhesin  29.68 
 
 
404 aa  89.4  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  26.84 
 
 
536 aa  89.4  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  27.86 
 
 
575 aa  89  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0311  Brp family immunodominant surface antigen  32.45 
 
 
551 aa  88.6  8e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  26.32 
 
 
2141 aa  88.2  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0768  YadA domain-containing protein  26.23 
 
 
997 aa  86.7  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  24.44 
 
 
548 aa  85.5  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  48.42 
 
 
977 aa  85.5  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  39.27 
 
 
1190 aa  85.5  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>