More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1450 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  100 
 
 
443 aa  882    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1862  signal recognition particle protein  71.63 
 
 
444 aa  618  1e-176  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000295764  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  57.81 
 
 
453 aa  500  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  55.1 
 
 
443 aa  491  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  55.51 
 
 
492 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  53.95 
 
 
508 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  56.07 
 
 
512 aa  490  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  55.74 
 
 
512 aa  487  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  57.11 
 
 
446 aa  484  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.76 
 
 
481 aa  480  1e-134  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  54.78 
 
 
455 aa  479  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  52.81 
 
 
518 aa  478  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  54.78 
 
 
455 aa  479  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.19 
 
 
447 aa  476  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  54.38 
 
 
445 aa  476  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  55.81 
 
 
444 aa  476  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  53.72 
 
 
455 aa  473  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  56.53 
 
 
447 aa  473  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  54.4 
 
 
448 aa  472  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.89 
 
 
490 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  53.26 
 
 
476 aa  469  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  56.59 
 
 
446 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  55.58 
 
 
446 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  54.65 
 
 
449 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  54.01 
 
 
469 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  53.67 
 
 
520 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  54.33 
 
 
449 aa  464  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  54.98 
 
 
448 aa  464  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  54.1 
 
 
449 aa  463  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  54.1 
 
 
449 aa  463  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  54.1 
 
 
449 aa  463  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  54.33 
 
 
449 aa  464  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  54.1 
 
 
449 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  54.33 
 
 
449 aa  464  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1142  signal recognition particle protein  52.55 
 
 
485 aa  464  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0433759  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  54.1 
 
 
449 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  52.2 
 
 
450 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  51.86 
 
 
450 aa  460  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  53.86 
 
 
449 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  52.79 
 
 
449 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  53.86 
 
 
449 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4178  signal recognition particle protein  52.69 
 
 
488 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  51.38 
 
 
479 aa  459  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  53.69 
 
 
446 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0572  signal recognition particle protein  52.96 
 
 
492 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0589  signal recognition particle protein  52.96 
 
 
492 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  52.06 
 
 
521 aa  456  1e-127  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  54.29 
 
 
446 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1967  signal recognition particle protein  55.34 
 
 
452 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000299479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1685  signal recognition particle protein  55.34 
 
 
452 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2535  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.84 
 
 
483 aa  455  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00293209  normal  0.012093 
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  51.91 
 
 
445 aa  453  1.0000000000000001e-126  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  53.41 
 
 
433 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  52.9 
 
 
439 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  51.63 
 
 
443 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  50.57 
 
 
449 aa  453  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.3 
 
 
507 aa  454  1.0000000000000001e-126  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  52.37 
 
 
441 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  53.3 
 
 
493 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  53.13 
 
 
451 aa  448  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  53.09 
 
 
449 aa  449  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  51.36 
 
 
440 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  53.44 
 
 
442 aa  451  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  52.95 
 
 
433 aa  449  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.91 
 
 
443 aa  448  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  48.98 
 
 
444 aa  448  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  51.61 
 
 
444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1725  signal recognition particle protein  52.53 
 
 
518 aa  445  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.862121  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1561  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.45 
 
 
491 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  51.61 
 
 
444 aa  445  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  54.13 
 
 
453 aa  442  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0998  signal recognition particle protein  53.21 
 
 
459 aa  444  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4020  signal recognition particle protein  51.05 
 
 
489 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000574509 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  52.42 
 
 
463 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  51.03 
 
 
441 aa  444  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.59 
 
 
462 aa  443  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  51.12 
 
 
449 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13331  signal recognition particle protein (SRP54)  50.23 
 
 
485 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.367944  normal  0.587075 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.89 
 
 
452 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  53.9 
 
 
453 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05915  signal recognition particle protein  53.7 
 
 
442 aa  438  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.414308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  52.09 
 
 
453 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  51.41 
 
 
453 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2891  signal recognition particle protein  51.41 
 
 
453 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0766211  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  50.94 
 
 
453 aa  435  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0882  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.96 
 
 
492 aa  437  1e-121  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.553698  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1771  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.6 
 
 
496 aa  436  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  51.41 
 
 
453 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  51.41 
 
 
453 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  52.78 
 
 
452 aa  436  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  51.26 
 
 
449 aa  435  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  51.41 
 
 
453 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1064  signal recognition particle protein  50.94 
 
 
453 aa  434  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203805  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  50.46 
 
 
458 aa  432  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3849  signal recognition particle protein  50.94 
 
 
453 aa  434  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000605639  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  50.94 
 
 
453 aa  434  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17061  signal recognition particle protein (SRP54)  49.42 
 
 
487 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254575  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1018  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.92 
 
 
458 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.868706  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2769  signal recognition particle protein  50.94 
 
 
453 aa  434  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000211534  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.35 
 
 
449 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>