More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1447 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1447  ribosomal protein S16  100 
 
 
88 aa  178  2.9999999999999997e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1863  ribosomal protein S16  76.4 
 
 
89 aa  142  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000617647  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  57.65 
 
 
90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  55.29 
 
 
90 aa  105  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  56.47 
 
 
90 aa  105  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  52.87 
 
 
93 aa  94.4  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  45.88 
 
 
139 aa  89.4  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  47.06 
 
 
90 aa  88.6  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2025  ribosomal protein S16  50.67 
 
 
81 aa  89  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000392366  normal  0.0104179 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  43.53 
 
 
88 aa  89  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  43.53 
 
 
90 aa  88.2  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  48.05 
 
 
81 aa  87.8  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  41.86 
 
 
90 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  41.86 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  41.86 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  41.86 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  41.86 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  41.86 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  41.86 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  42.35 
 
 
91 aa  86.7  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  41.86 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  41.86 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  41.86 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  41.86 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  51.22 
 
 
95 aa  85.9  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  47.67 
 
 
91 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0547  30S ribosomal protein S16  46.51 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  43.53 
 
 
90 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  48.86 
 
 
91 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  48.86 
 
 
91 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  49.38 
 
 
88 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  49.38 
 
 
88 aa  85.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  42.35 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0665  30S ribosomal protein S16  48.84 
 
 
101 aa  85.1  3e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  hitchhiker  0.0000270999  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0320  ribosomal protein S16  41.86 
 
 
111 aa  83.6  9e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000084035  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
88 aa  83.6  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  46.84 
 
 
81 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  46.91 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  45.45 
 
 
81 aa  81.3  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  43.53 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0646  30S ribosomal protein S16  43.18 
 
 
90 aa  80.5  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl542  30S ribosomal protein S16  43.02 
 
 
89 aa  80.5  0.000000000000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264239  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  41.18 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1398  30S ribosomal protein S16  43.59 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000212857  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2181  30S ribosomal protein S16  40.74 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20607  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2772  30S ribosomal protein S16  46.43 
 
 
82 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.48934 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  39.76 
 
 
131 aa  79  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  42.86 
 
 
81 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1561  SSU ribosomal protein S16P  41.98 
 
 
174 aa  79  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0890595 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  40 
 
 
96 aa  78.2  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1805  30S ribosomal protein S16  37.93 
 
 
95 aa  77.8  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000294952  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  46.75 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  46.34 
 
 
85 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0542  30S ribosomal protein S16  48.72 
 
 
82 aa  77.4  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000153303  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0966  30S ribosomal protein S16  46.15 
 
 
195 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000085544  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  48.05 
 
 
82 aa  77  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2142  30S ribosomal protein S16  44.59 
 
 
79 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1524  30S ribosomal protein S16  42.31 
 
 
135 aa  76.6  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000501914  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5264  30S ribosomal protein S16  45.24 
 
 
82 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.121257 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1099  30S ribosomal protein S16  44.59 
 
 
79 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.280704  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1492  30S ribosomal protein S16  44.87 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990353  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1092  ribosomal protein S16  49.38 
 
 
119 aa  76.3  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000161695  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2223  ribosomal protein S16  40.74 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000817151 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  41.46 
 
 
86 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_507  ribosomal protein S16  47.44 
 
 
82 aa  75.5  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000394154  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2607  30S ribosomal protein S16  47.06 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.152085  normal  0.0124083 
 
 
-
 
NC_002936  DET0568  30S ribosomal protein S16  47.44 
 
 
82 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000021123  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1143  30S ribosomal protein S16  45.88 
 
 
86 aa  75.1  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0121256  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1305  30S ribosomal protein S16  40.74 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951673  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1772  30S ribosomal protein S16  46.43 
 
 
82 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  44.3 
 
 
81 aa  74.3  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  38.82 
 
 
88 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0224  ribosomal protein S16  41.98 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1956  30S ribosomal protein S16  45.24 
 
 
82 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1983  30S ribosomal protein S16  45.24 
 
 
82 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000439019  normal  0.0268459 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  39.51 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1194  30S ribosomal protein S16  40.74 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282957  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2887  30S ribosomal protein S16  41.89 
 
 
79 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40242 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  41.18 
 
 
96 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1803  30S ribosomal protein S16  43.24 
 
 
79 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.013631  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2483  SSU ribosomal protein S16P  39.51 
 
 
157 aa  73.6  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0481662  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4357  30S ribosomal protein S16  45.24 
 
 
86 aa  73.6  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000000929169  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1301  30S ribosomal protein S16  44.74 
 
 
188 aa  73.6  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0662  SSU ribosomal protein S16P  40.74 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.646804  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  41.56 
 
 
86 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0109  30S ribosomal protein S16  44.16 
 
 
119 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  40.74 
 
 
88 aa  72  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3594  30S ribosomal protein S16  40.74 
 
 
148 aa  72  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0749  30S ribosomal protein S16  43.53 
 
 
130 aa  72  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1226  30S ribosomal protein S16  36.05 
 
 
95 aa  72  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  41.03 
 
 
81 aa  72  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  41.03 
 
 
81 aa  72  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1229  30S ribosomal protein S16  36.05 
 
 
95 aa  72  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888168  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1405  30S ribosomal protein S16  44.58 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.321443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  38.37 
 
 
88 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2536  SSU ribosomal protein S16P  45 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000571366  decreased coverage  0.00236598 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0103  30S ribosomal protein S16  40.24 
 
 
183 aa  72  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11040  SSU ribosomal protein S16P  38.27 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0237253  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1148  30S ribosomal protein S16  39.02 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0271255 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  44 
 
 
81 aa  71.2  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>