More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1439 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
325 aa  658    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0640  ribose-phosphate pyrophosphokinase  72.7 
 
 
318 aa  480  1e-134  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00660234  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.78 
 
 
316 aa  390  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.77 
 
 
325 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.24 
 
 
317 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.24 
 
 
317 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.24 
 
 
317 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.24 
 
 
317 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.24 
 
 
317 aa  381  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.24 
 
 
317 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.24 
 
 
317 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.24 
 
 
317 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.92 
 
 
317 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.24 
 
 
317 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.24 
 
 
317 aa  381  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.29 
 
 
315 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.62 
 
 
315 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.65 
 
 
314 aa  373  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.44 
 
 
317 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.46 
 
 
322 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.63 
 
 
316 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.33 
 
 
319 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.01 
 
 
319 aa  364  1e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 
319 aa  363  2e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1951  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  57.96 
 
 
326 aa  363  2e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000760299  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.56 
 
 
329 aa  360  1e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.31 
 
 
315 aa  359  4e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  54.84 
 
 
317 aa  357  9.999999999999999e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.84 
 
 
313 aa  355  6.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.48 
 
 
331 aa  353  2e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  57.05 
 
 
327 aa  353  2e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0873  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.09 
 
 
324 aa  353  2.9999999999999997e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.19 
 
 
314 aa  352  5.9999999999999994e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.37 
 
 
338 aa  351  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.81 
 
 
322 aa  350  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.99 
 
 
330 aa  349  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.92 
 
 
318 aa  349  4e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.04 
 
 
338 aa  347  2e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.1 
 
 
316 aa  347  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.78 
 
 
316 aa  345  6e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0043  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.59 
 
 
321 aa  345  6e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.270111  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.02 
 
 
314 aa  342  4e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0018  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.87 
 
 
322 aa  340  1e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00325732  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0522  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.75 
 
 
321 aa  341  1e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00402651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0535  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.75 
 
 
321 aa  341  1e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0143488  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.17 
 
 
316 aa  341  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.22 
 
 
330 aa  341  1e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.35 
 
 
314 aa  340  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.33 
 
 
315 aa  339  4e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767857  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.99 
 
 
314 aa  339  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.63 
 
 
318 aa  338  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.63 
 
 
318 aa  338  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0969  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.98 
 
 
329 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1163  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.17 
 
 
315 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.285484  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0138  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.48 
 
 
321 aa  336  3.9999999999999995e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.056526  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2630  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.45 
 
 
320 aa  335  5e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.28 
 
 
330 aa  335  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1292  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.55 
 
 
315 aa  330  1e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.9 
 
 
309 aa  331  1e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.57 
 
 
309 aa  330  2e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.21 
 
 
323 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  53.53 
 
 
312 aa  329  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0161  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.87 
 
 
316 aa  329  3e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.63 
 
 
337 aa  329  4e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.27 
 
 
315 aa  328  6e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.92 
 
 
321 aa  328  8e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1015  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
309 aa  328  9e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.68 
 
 
331 aa  327  1.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.85 
 
 
327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0126613  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.16 
 
 
314 aa  326  3e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.04 
 
 
315 aa  326  3e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1453  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.57 
 
 
316 aa  325  5e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.56 
 
 
311 aa  325  7e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.27 
 
 
309 aa  325  8.000000000000001e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1371  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.48 
 
 
331 aa  323  2e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11701  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.27 
 
 
331 aa  323  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.08 
 
 
314 aa  323  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000977539  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.97 
 
 
308 aa  323  3e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1256  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.27 
 
 
311 aa  323  3e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.65 
 
 
309 aa  323  3e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3730  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.35 
 
 
316 aa  322  5e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.322716 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1760  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.72 
 
 
314 aa  322  7e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290937  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3256  ribose-phosphate diphosphokinase  51.28 
 
 
313 aa  322  7e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.0151507 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0786  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.23 
 
 
332 aa  322  7e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000113332  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2365  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.5 
 
 
316 aa  321  8e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
331 aa  322  8e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.147095  normal  0.740679 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1986  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.59 
 
 
315 aa  321  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.675824  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0589  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.48 
 
 
316 aa  320  9.999999999999999e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1409  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.18 
 
 
317 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70704  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2068  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.59 
 
 
315 aa  321  9.999999999999999e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11861  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.27 
 
 
331 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.669789  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.05 
 
 
316 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.27 
 
 
331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.319247  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.57 
 
 
321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.05 
 
 
316 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.97 
 
 
309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2165  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.7 
 
 
310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0174  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.7 
 
 
310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.1 
 
 
321 aa  319  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.1 
 
 
321 aa  319  3e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>