56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1400 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1400  PTS system Galactitol-specific IIC component  100 
 
 		 440 aa  850    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1734  PTS system Galactitol-specific IIC component  36.77 
 
 		 453 aa  329  6e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3720  PTS system Galactitol-specific IIC component  29.74 
 
 		 415 aa  201  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.260527  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3555  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  28.3 
 
 		 457 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3449  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  28.3 
 
 		 457 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3447  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  28.3 
 
 		 457 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3518  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  28.3 
 
 		 457 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3615  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIC  28.3 
 
 		 457 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0034  PTS system Galactitol-specific IIC component  28.12 
 
 		 454 aa  196  5.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3157  PTS system Galactitol-specific IIC component  27.33 
 
 		 448 aa  194  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2380  PTS system, galactitol-specific IIC component  27.29 
 
 		 451 aa  189  7e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0972  PTS system, galactitol-specific IIC component  27.07 
 
 		 451 aa  188  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.487394 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2228  PTS system, galactitol-specific IIC component  27.07 
 
 		 451 aa  188  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.921668  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3071  PTS system, galactitol-specific IIC component  27.07 
 
 		 451 aa  188  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000414376 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1146  PTS system, galactitol-specific IIC component  26.85 
 
 		 451 aa  188  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01984  hypothetical protein  27.07 
 
 		 451 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1566  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  27.07 
 
 		 451 aa  188  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00428994  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02018  galactitol-specific enzyme IIC component of PTS  27.07 
 
 		 451 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0238  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  27.43 
 
 		 419 aa  186  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1555  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  27.56 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0232  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  27.43 
 
 		 419 aa  186  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0036  PTS system Galactitol-specific IIC component  30.32 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1933  PTS system, IIC component, putative  30.75 
 
 		 482 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.527241  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3769  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIC component  26.56 
 
 		 452 aa  176  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4825  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIC component  26.56 
 
 		 452 aa  176  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3385  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  28.02 
 
 		 463 aa  173  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0012361  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0235  galacitol PTS, EIIC  25.51 
 
 		 445 aa  173  5e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1142  PTS system, galactitol-specific IIC component  26.98 
 
 		 452 aa  171  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4119  PTS system galactitol-specific IIC component  30.29 
 
 		 469 aa  170  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00198911  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3750  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  24.55 
 
 		 440 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04169  predicted phosphotransferase enzyme IIC component  25.26 
 
 		 437 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04131  hypothetical protein  25.26 
 
 		 437 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3696  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  25.26 
 
 		 437 aa  160  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0497  galactitol PTS, EIIC  26.29 
 
 		 472 aa  158  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000187938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3992  PTS system, galactitol-specific IIC component  26.38 
 
 		 452 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal  0.82636 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4008  PTS system, galactitol-specific IIC component  26.97 
 
 		 452 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4113  PTS system galactitol-specific IIC component  26.97 
 
 		 452 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4063  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIC  26.97 
 
 		 452 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal  0.771643 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1731  PTS system, IIc component  25.26 
 
 		 437 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1792  PTS system IIc component  25.26 
 
 		 437 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1728  PTS system transporter subunit IIC  25.26 
 
 		 437 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118537  normal  0.433855 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1728  PTS system transporter subunit IIC  25.26 
 
 		 437 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1547  PTS system, IIc component  25.26 
 
 		 437 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2223  PTS system galactitol-specific IIC component  27.82 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.756682 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0152  PTS system Galactitol-specific IIC component  29.05 
 
 		 474 aa  147  3e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0975812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1647  PTS system galactitol-specific IIC component  25.38 
 
 		 417 aa  146  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444163 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1642  PTS system galactitol-specific IIC component  24.89 
 
 		 456 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000536368 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3260  galacitol pts, eiic  24.82 
 
 		 456 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0579049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3255  PTS system galactitol-specific IIC component  25.32 
 
 		 417 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0413472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0216  PTS system Galactitol-specific IIC component  23.36 
 
 		 421 aa  133  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3552  PTS system Galactitol-specific IIC component  25.06 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1805  PTS system, IIC component, putative  22.42 
 
 		 483 aa  95.1  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1836  galacitol PTS, EIIC  22.74 
 
 		 484 aa  87.4  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000025524  normal  0.329345 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0123  PTS system galactitol-specific IIC component  18.49 
 
 		 459 aa  69.3  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0161618  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1671  PTS system galactitol-specific IIC component  21.56 
 
 		 470 aa  62  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000013892  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1835  galacitol PTS, EIIC  20.92 
 
 		 438 aa  51.6  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.372507 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>