More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1379 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1379  Peptidase M23  100 
 
 
420 aa  823    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  43.01 
 
 
455 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  27.21 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  26.8 
 
 
397 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  23.29 
 
 
402 aa  104  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  27.36 
 
 
397 aa  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  28.57 
 
 
374 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3699  peptidase M23B  36.89 
 
 
379 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  27.13 
 
 
400 aa  100  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  35.96 
 
 
509 aa  96.7  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  26.24 
 
 
379 aa  97.1  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  27.27 
 
 
376 aa  96.7  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  28.63 
 
 
426 aa  94.7  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3807  peptidase M23B  26.13 
 
 
361 aa  93.6  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.759615  normal  0.544086 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  25.67 
 
 
378 aa  93.6  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  23.16 
 
 
366 aa  93.6  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  40.8 
 
 
530 aa  92.8  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4218  peptidase M23B  37.19 
 
 
377 aa  92.4  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  40 
 
 
534 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  35.25 
 
 
382 aa  92  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  25.69 
 
 
375 aa  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  24.87 
 
 
378 aa  92  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3002  Peptidase M23  25.87 
 
 
448 aa  90.5  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00185035  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  24.15 
 
 
434 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  28.94 
 
 
387 aa  90.5  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  37.4 
 
 
394 aa  89.7  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  24.31 
 
 
440 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0521  LysM/M23 peptidase  40.15 
 
 
397 aa  89.4  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.939953  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  32.79 
 
 
344 aa  88.6  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  32.79 
 
 
377 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  32.79 
 
 
377 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146051 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  38.4 
 
 
538 aa  87.4  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  32.79 
 
 
377 aa  87  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  27.91 
 
 
433 aa  87  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  27.73 
 
 
362 aa  86.3  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  32.67 
 
 
323 aa  86.7  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  28.03 
 
 
396 aa  86.3  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1429  putative lipoprotein  35.06 
 
 
279 aa  86.3  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000184738  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  36.43 
 
 
374 aa  86.3  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  29.67 
 
 
424 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  31.2 
 
 
362 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  32.81 
 
 
404 aa  85.5  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  34.92 
 
 
372 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  31.2 
 
 
362 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  29.29 
 
 
387 aa  86.3  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0683  Peptidase M23  29.52 
 
 
472 aa  85.5  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295587 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  23.19 
 
 
398 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00544  peptidase, M23/M37 family protein  34.43 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0525  M23/M37 peptidase domain protein  29.52 
 
 
472 aa  85.5  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  27.73 
 
 
362 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  33.86 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  24.68 
 
 
372 aa  84.3  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  33.53 
 
 
412 aa  84.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  22.94 
 
 
404 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  23.57 
 
 
441 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4471  peptidase M23B  32.23 
 
 
377 aa  84  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.211003  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  34.15 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2736  peptidase family protein  33.61 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0304965  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2422  peptidase M23B  39.02 
 
 
475 aa  82.8  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000638116  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  27.31 
 
 
430 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  35.07 
 
 
478 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  28.76 
 
 
481 aa  82.4  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4022  peptidase M23B  33.61 
 
 
377 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  39.02 
 
 
328 aa  82.4  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  24.16 
 
 
433 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  29.06 
 
 
379 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  33.33 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3112  peptidase M23B  33.87 
 
 
633 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  22.04 
 
 
394 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  32.52 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  38.76 
 
 
438 aa  81.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  35.48 
 
 
452 aa  82.4  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  32.23 
 
 
477 aa  81.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  36.36 
 
 
474 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  26.56 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  31.97 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  33.33 
 
 
372 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  28.57 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  28.57 
 
 
456 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  25.46 
 
 
441 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  28.57 
 
 
456 aa  80.5  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  23.25 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  33.33 
 
 
412 aa  79.7  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4091  hypothetical protein  33.86 
 
 
427 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  35.54 
 
 
453 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  21.88 
 
 
416 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  23.19 
 
 
388 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3904  hypothetical protein  33.86 
 
 
427 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3923  hypothetical protein  33.86 
 
 
427 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3610  peptidase M23B  32.48 
 
 
363 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  31.5 
 
 
417 aa  79.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  32.52 
 
 
405 aa  79.7  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3985  hypothetical protein  33.86 
 
 
427 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.910741 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3942  hypothetical protein  32.52 
 
 
424 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4030  hypothetical protein  33.86 
 
 
427 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  36.36 
 
 
449 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  38.76 
 
 
427 aa  77.8  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  38.76 
 
 
427 aa  77.8  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  23.21 
 
 
428 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  36.36 
 
 
471 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>