More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1342 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 493 aa  993    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  44.81 
 
 		 515 aa  383  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  41.79 
 
 		 522 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  40.52 
 
 		 509 aa  358  9e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  41.77 
 
 		 499 aa  349  6e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  38 
 
 		 654 aa  332  8e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  40 
 
 		 575 aa  301  1e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  34.52 
 
 		 588 aa  291  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  34.17 
 
 		 545 aa  283  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  38.1 
 
 		 595 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  35.91 
 
 		 583 aa  279  8e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  36.29 
 
 		 593 aa  278  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  34.35 
 
 		 541 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  33.26 
 
 		 541 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  36.44 
 
 		 455 aa  262  1e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0568  alpha amylase catalytic region  35.27 
 
 		 441 aa  258  2e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.489897  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  37.71 
 
 		 454 aa  256  7e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  34.5 
 
 		 441 aa  254  3e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  38.35 
 
 		 815 aa  251  2e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  32.97 
 
 		 558 aa  248  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1849  alpha-amylase  31.5 
 
 		 524 aa  228  2e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  47.84 
 
 		 258 aa  224  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  33.93 
 
 		 555 aa  223  8e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  30.36 
 
 		 549 aa  221  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  29.4 
 
 		 538 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  33.73 
 
 		 555 aa  220  5e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  30.22 
 
 		 549 aa  218  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  30.22 
 
 		 549 aa  218  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2115  alpha amylase catalytic region  31.47 
 
 		 553 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  0.0296214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3928  alpha amylase catalytic region  30.77 
 
 		 544 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8020  trehalose synthase  29.74 
 
 		 553 aa  214  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  31.91 
 
 		 562 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  30.68 
 
 		 568 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0214  alpha-glucosidase  34.65 
 
 		 552 aa  208  2e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417345 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1908  alpha amylase catalytic region  31.08 
 
 		 553 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.834785  normal  0.122197 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2621  alpha amylase catalytic region  30.49 
 
 		 554 aa  207  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1579  alpha amylase catalytic region  31.08 
 
 		 543 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  29.34 
 
 		 545 aa  206  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  29.86 
 
 		 548 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1176  alpha amylase catalytic region  33.06 
 
 		 647 aa  206  1e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  29.46 
 
 		 525 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  28.94 
 
 		 533 aa  205  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5237  alpha amylase catalytic region  31.3 
 
 		 554 aa  203  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0387802 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  27.53 
 
 		 534 aa  203  5e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  29.56 
 
 		 606 aa  202  8e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  30.5 
 
 		 543 aa  202  8e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  28.35 
 
 		 536 aa  202  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  30.41 
 
 		 554 aa  202  9e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1378  alpha amylase catalytic region  30.02 
 
 		 553 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000100533  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  29.26 
 
 		 563 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  26.57 
 
 		 545 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  31.31 
 
 		 554 aa  201  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0438  trehalose-6-phosphate hydrolase  28.44 
 
 		 551 aa  201  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.683069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  29.76 
 
 		 557 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1968  alpha amylase catalytic region  28.68 
 
 		 554 aa  200  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0897  trehalose-6-phosphate hydrolase  28.01 
 
 		 556 aa  201  3.9999999999999996e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.175919  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3114  alpha amylase catalytic region  28.57 
 
 		 579 aa  200  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4604  alpha amylase catalytic region  29.55 
 
 		 554 aa  200  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0894643  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  29.53 
 
 		 550 aa  200  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2596  alpha amylase, catalytic region  27.83 
 
 		 558 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0937  alpha amylase domain-containing protein  27.83 
 
 		 548 aa  199  9e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0494  trehalose-6-phosphate hydrolase  27.79 
 
 		 553 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  29.15 
 
 		 1093 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2342  alpha amylase catalytic region  31.54 
 
 		 538 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  28.46 
 
 		 540 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  27.99 
 
 		 535 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0430  trehalose-6-phosphate hydrolase  27.5 
 
 		 555 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1164  trehalose-6-phosphate hydrolase  27.5 
 
 		 555 aa  197  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.679252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0624  alpha amylase catalytic region  30.63 
 
 		 570 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00268544  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  28.76 
 
 		 553 aa  196  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  29.04 
 
 		 532 aa  196  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  31.25 
 
 		 555 aa  195  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  27.94 
 
 		 1109 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4138  alpha amylase catalytic region  30.17 
 
 		 541 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  30.94 
 
 		 554 aa  195  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  31.03 
 
 		 554 aa  195  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  28.21 
 
 		 529 aa  194  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  28.6 
 
 		 540 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1603  alpha amylase catalytic region  30.21 
 
 		 554 aa  194  3e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000968128  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2978  alpha amylase, catalytic region  27.75 
 
 		 548 aa  194  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.533119  normal  0.0820165 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  28.68 
 
 		 551 aa  193  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0828  trehalose-6-phosphate hydrolase  27.31 
 
 		 556 aa  193  6e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0959378  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0942  oligo-1,6-glucosidase, putative  28.99 
 
 		 539 aa  192  8e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2083  alpha amylase catalytic region  29.21 
 
 		 541 aa  192  8e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.583803 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4038  alpha amylase catalytic region  29.88 
 
 		 544 aa  192  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0583407  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  28.52 
 
 		 551 aa  192  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  30.06 
 
 		 524 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  28.01 
 
 		 543 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  29.21 
 
 		 562 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  27.9 
 
 		 1116 aa  192  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  28.85 
 
 		 682 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  28.69 
 
 		 543 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  29.02 
 
 		 538 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  28.46 
 
 		 1116 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  26.93 
 
 		 538 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5238  alpha amylase catalytic region  33.68 
 
 		 524 aa  190  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  29.07 
 
 		 1108 aa  190  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  28.82 
 
 		 1092 aa  189  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  29.21 
 
 		 1105 aa  189  7e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  28.93 
 
 		 538 aa  189  8e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>