More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1268 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1268  ribosomal protein S5  100 
 
 		 165 aa  316  9e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3978  ribosomal protein S5  83.44 
 
 		 168 aa  271  3e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  61.15 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  56.97 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  60.51 
 
 		 166 aa  182  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  56.36 
 
 		 166 aa  180  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  59.24 
 
 		 166 aa  178  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  50.3 
 
 		 172 aa  177  5.999999999999999e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  60.38 
 
 		 163 aa  177  8e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  56.05 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  59.62 
 
 		 166 aa  175  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  56.41 
 
 		 168 aa  175  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  57.32 
 
 		 166 aa  174  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  58.6 
 
 		 169 aa  174  7e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  58.6 
 
 		 169 aa  174  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  55.69 
 
 		 168 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  57.96 
 
 		 169 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  57.32 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  57.86 
 
 		 163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  57.32 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  56.02 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  57.06 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  56.6 
 
 		 163 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  56.05 
 
 		 165 aa  170  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  56.05 
 
 		 165 aa  170  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  56.69 
 
 		 166 aa  170  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  56.69 
 
 		 166 aa  170  9e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  56.69 
 
 		 166 aa  170  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  56.69 
 
 		 166 aa  170  9e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  56.69 
 
 		 166 aa  170  9e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  56.69 
 
 		 166 aa  170  9e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  56.69 
 
 		 166 aa  170  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  56.69 
 
 		 166 aa  170  9e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  56.69 
 
 		 166 aa  170  9e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  54.49 
 
 		 164 aa  169  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  56.05 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0422  30S ribosomal protein S5  54.94 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0728588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3805  30S ribosomal protein S5  54.32 
 
 		 166 aa  168  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000511085  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3984  30S ribosomal protein S5  54.32 
 
 		 166 aa  168  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183647  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0410  ribosomal protein S5  54.94 
 
 		 167 aa  168  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117054  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3688  30S ribosomal protein S5  54.94 
 
 		 167 aa  168  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204497  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3790  30S ribosomal protein S5  54.94 
 
 		 167 aa  168  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3497  30S ribosomal protein S5  54.94 
 
 		 167 aa  168  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000313723  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3727  30S ribosomal protein S5  54.94 
 
 		 167 aa  168  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0653825 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3619  30S ribosomal protein S5  54.94 
 
 		 167 aa  168  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00166416  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3598  30S ribosomal protein S5  54.94 
 
 		 167 aa  168  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00671988  normal  0.0253177 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0410  30S ribosomal protein S5  54.94 
 
 		 167 aa  168  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000646681  hitchhiker  0.00000284656 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3619  30S ribosomal protein S5  54.94 
 
 		 167 aa  168  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0273199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3734  30S ribosomal protein S5  54.94 
 
 		 166 aa  168  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000123332  decreased coverage  0.00107093 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4626  30S ribosomal protein S5  54.94 
 
 		 167 aa  168  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000983466  normal  0.887849 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3692  30S ribosomal protein S5  54.94 
 
 		 167 aa  168  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0779682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3786  30S ribosomal protein S5  54.94 
 
 		 167 aa  168  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000185577  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0340  30S ribosomal protein S5  53.7 
 
 		 166 aa  167  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000106255  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0077  30S ribosomal protein S5  54.32 
 
 		 166 aa  166  9e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0793538  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  55.9 
 
 		 173 aa  166  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03154  30S ribosomal protein S5  54.32 
 
 		 167 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387677  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0443  30S ribosomal protein S5  53.94 
 
 		 165 aa  165  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000313397  hitchhiker  0.000112579 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  56.13 
 
 		 168 aa  165  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03105  hypothetical protein  54.32 
 
 		 167 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00221736  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  56.67 
 
 		 163 aa  164  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4527  30S ribosomal protein S5  53.7 
 
 		 167 aa  164  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000233492  hitchhiker  0.000167424 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1850  30S ribosomal protein S5  53.55 
 
 		 177 aa  164  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.697613 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3897  30S ribosomal protein S5  53.7 
 
 		 167 aa  164  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777438  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0600  30S ribosomal protein S5  53.7 
 
 		 167 aa  164  5.9999999999999996e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155795  normal  0.912114 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0300  30S ribosomal protein S5  53.7 
 
 		 167 aa  164  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000391785  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  54.3 
 
 		 166 aa  164  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  54.3 
 
 		 166 aa  164  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2157  30S ribosomal protein S5  52.73 
 
 		 167 aa  164  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000232198  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0773  30S ribosomal protein S5  52.53 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  53.8 
 
 		 163 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00747  30S ribosomal protein S5  52.12 
 
 		 167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001725  SSU ribosomal protein S5p (S2e)  52.12 
 
 		 167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000199413  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1167  ribosomal protein S5  58.44 
 
 		 172 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0511259  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  52.98 
 
 		 166 aa  160  6e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0506  30S ribosomal protein S5  54.55 
 
 		 171 aa  160  6e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00232131  hitchhiker  0.00336065 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3162  30S ribosomal protein S5  52.26 
 
 		 172 aa  160  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.02216  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0501  30S ribosomal protein S5  54.55 
 
 		 171 aa  160  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000846661  normal  0.0709882 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  51.92 
 
 		 173 aa  160  6e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  51.28 
 
 		 165 aa  160  9e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00955  30S ribosomal protein S5  50.92 
 
 		 166 aa  160  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  55.41 
 
 		 167 aa  160  9e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0998  ribosomal protein S5  52.56 
 
 		 176 aa  160  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.476174  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3002  30S ribosomal protein S5  52.26 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.214721  normal  0.0562945 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  55.19 
 
 		 163 aa  159  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0619  30S ribosomal protein S5  53.85 
 
 		 172 aa  158  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.797529 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  53.5 
 
 		 168 aa  158  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0970  30S ribosomal protein S5  46.99 
 
 		 176 aa  158  3e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0345  ribosomal protein S5  51.23 
 
 		 167 aa  157  4e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0283353  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0274  30S ribosomal protein S5  55.19 
 
 		 194 aa  158  4e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.129476  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0282  30S ribosomal protein S5  49.68 
 
 		 189 aa  158  4e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000515856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  55.7 
 
 		 162 aa  157  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  54 
 
 		 182 aa  157  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0976  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 		 170 aa  157  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0109709  hitchhiker  0.0000385854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4259  ribosomal protein S5  49.38 
 
 		 166 aa  157  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000144419  unclonable  0.00000000000259852 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3300  30S ribosomal protein S5  50.97 
 
 		 172 aa  157  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 		 180 aa  157  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  51.92 
 
 		 174 aa  157  8e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  53.16 
 
 		 162 aa  157  9e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf423  ribosomal protein S5  49.36 
 
 		 234 aa  156  1e-37  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>